ทุกอย่างเริ่มต้นที่ราก พืชได้รับสารอาหารจากสองระบบที่แตกต่างกัน ระบบแรกเริ่มที่ใบและมีหน้าที่ในการสังเคราะห์แสง อีกส่วนหนึ่งเริ่มต้นที่รากและเคลื่อนน้ำที่เต็มไปด้วยไอออนที่ละลายผ่านพืช โปรตีนเป็นหนึ่งในสารอาหารที่เริ่มต้นที่รากและทำงานขึ้นด้านบน
พืชเป็นออโตโทรฟ
พืชเป็นออโตโทรฟ ซึ่งแตกต่างจากสัตว์ที่ต้องได้รับอาหารจากแหล่งภายนอกเช่นพืชและสัตว์อื่น ๆ พืชสามารถผลิตได้เอง พืชนำองค์ประกอบพื้นฐานจากโลกภายนอกมาสู่ร่างกาย โดยที่พวกมันจะถูกแปลงเป็นแป้งและโปรตีนที่พืชหรือสัตว์กินเข้าไปได้
ไนโตรเจนและแบคทีเรีย
โปรตีนทำมาจากไนเตรต ซึ่งเป็นรูปแบบของไนโตรเจนที่จุลินทรีย์จับยึด พืชไม่สามารถใช้ไนโตรเจนโดยตรงได้ ดังนั้นพืชจึงอาศัยแบคทีเรียในการเปลี่ยนไนโตรเจนให้อยู่ในรูปแบบที่สามารถใช้ได้ แบคทีเรียเหล่านี้อาศัยอยู่ใกล้รากของพืชหรือในโครงสร้างพิเศษบนรากที่เรียกว่าก้อน แบคทีเรียในก้อนทำให้เกิดความสัมพันธ์ทางชีวภาพกับพืชที่แลกเปลี่ยนไนโตรเจนที่ใช้งานได้กับน้ำตาลจากพืช
ไนเตรตและกรดอะมิโน
ไนเตรตที่นำเข้าสู่พืชผ่านทางรากจะถูกดึงเข้าไปในพืช โดยจะเปลี่ยนเป็นกรดอะมิโน 20 ชนิดที่แตกต่างกัน กรดอะมิโนเหล่านี้จะกลายเป็นโปรตีนในโครงสร้างพิเศษในเซลล์ที่เรียกว่าไรโบโซม โครงสร้างเหล่านี้อยู่ในสี่แห่งในโรงงาน บางชนิดลอยได้อิสระในไซโตพลาสซึมของเซลล์ ในขณะที่บางชนิดติดอยู่ที่พื้นผิวของเอนโดพลาสมิก เรติคิวลัม ไมโทคอนเดรีย และคลอโรพลาสต์
การขนส่งโปรตีน
จากไรโบโซมที่มีอยู่ในเอนโดพลาสมิกเรติคิวลัม โปรตีนจะถูกส่งไปยังอุปกรณ์กอลจิ เครื่องมือกอลจิจะคัดแยกโปรตีนเหล่านั้นเพื่อกระจายไปทั่วพืช โดยจะใช้เพื่อสร้างโครงสร้างใหม่สำหรับการขนส่งสารอาหารต่อไป เช่นเดียวกับกระบวนการเผาผลาญขั้นพื้นฐาน