พืชเป็นพืชออโตโทรฟหรือได้รับสารอาหารทั้งหมดที่ต้องการจากสิ่งแวดล้อมรอบตัว น้ำฝนมีบทบาทสำคัญคือหน้าที่นี้ น้ำฝนเป็นวิธีที่เป็นธรรมชาติที่สุดสำหรับพืชที่จะได้รับความชื้น น้ำประปามักจะเติมสารเคมีเข้าไปในขณะที่บำบัดและนำกลับมาใช้ใหม่เพื่อการบริโภคของมนุษย์ น้ำฝนมีออกซิเจนในระดับที่สูงกว่า และปราศจากแร่ธาตุและสารเติมแต่งที่เป็นอันตรายที่พบในน้ำประปา ตามที่มหาวิทยาลัย Texas A&M
น้ำประกอบด้วยเนื้อเยื่อพืชล้มลุก 80 ถึง 95 และเนื้อเยื่อไม้ยืนต้น 50 เปอร์เซ็นต์ตามข้อมูลของมหาวิทยาลัยเคลมสัน น้ำนี้จะสูญเสียไปจากการคายน้ำ ซึ่งเป็นรูปแบบการระเหยตลอดทั้งวันและต้องเติมใหม่ ปัจจัยหลายประการ เช่น ความร้อน แสงแดด และชนิดของพืช เป็นตัวกำหนดอัตราการคายน้ำและปริมาณน้ำที่พืชแต่ละชนิดต้องการ พืชใช้ความชื้นในดินเพื่อเติมน้ำที่สูญเสียไปจากการคายน้ำ ถ้าไม่มีน้ำในดิน ใบไม้ก็จะเหี่ยวเฉา เมื่อสูญเสียน้ำมากขึ้น พืชก็จะล้มเหลวและตายในที่สุด น้ำฝนจะสร้างระดับความชื้นในดินและทำให้พืชมีสุขภาพแข็งแรง
น้ำฝนช่วยให้ธาตุอาหารและแร่ธาตุในดินที่พืชต้องการเพื่อความอยู่รอด เมื่อดินดูดซับน้ำฝน ฟิล์มจะก่อตัวขึ้นรอบๆ อนุภาคในดิน ตามที่วิทยาลัย Bellevue กล่าว รากจะดูดซับอนุภาคเหล่านี้ในกระบวนการที่เรียกว่าการแพร่กระจาย สารอาหารเหล่านี้ถูกส่งไปยังส่วนที่เหลือของพืช การขาดน้ำนำไปสู่การขาดแร่ธาตุและพืชที่ไม่แข็งแรง นอกจากนี้ พืชยังใช้น้ำควบคู่ไปกับกระบวนการสังเคราะห์แสงเพื่อผลิตน้ำตาล น้ำนำน้ำตาลนี้ผ่านพืชด้วยน้ำเพื่อเลี้ยงเซลล์พืชแต่ละเซลล์ จากนั้นเซลล์จะเปลี่ยนน้ำตาลเป็นพลังงาน ซึ่งพืชใช้ในการผลิตใบ ดอก และผล
ฝนกรดเป็นเรื่องปกติหลังจากการระเบิดของภูเขาไฟหรือเมื่อมีซัลเฟอร์ไดออกไซด์หรือไนโตรเจนออกไซด์ในปริมาณที่มากเกินไป ถูกปล่อยสู่อากาศจากการเผาไหม้เชื้อเพลิงฟอสซิล ตาม U.S. Environmental Protection หน่วยงาน ก๊าซเหล่านี้รวมกับน้ำและออกซิเจนในบรรยากาศเพื่อสร้างสารประกอบที่เป็นกรด เมื่อสารนี้ตกเป็นน้ำฝนดินจะดูดซับ ลักษณะที่เป็นกรดของน้ำฝนนี้จะละลายและขจัดสารอาหารในดินและเพิ่มแร่ธาตุที่เป็นอันตรายต่อพืช การสัมผัสกับฝนกรดบ่อยครั้งทำให้พืชตาย