เชื้อราและสาหร่ายมักสับสนและพูดคุยสลับกัน แท้จริงแล้ว ตะไคร่ที่มีตะไคร่น้ำซึ่งมักพบตามโขดหินและต้นไม้ แท้จริงแล้วเป็นการรวมกันของเชื้อราและสาหร่ายบางชนิด อย่างไรก็ตาม จริงๆ แล้วเชื้อราและสาหร่ายนั้นแตกต่างกันมากในแง่ส่วนใหญ่ ตัวอย่างเช่น ในขณะที่สาหร่ายเป็นสมาชิกของอาณาจักรโพรทิสตา เชื้อราเป็นสมาชิกของอาณาจักรพืช นอกจากนี้ สาหร่ายไม่มีรากหรือลำต้นไม่เหมือนกับเชื้อราหลายชนิด อย่างไรก็ตาม แม้จะมีความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญ แต่ก็มีความคล้ายคลึงกันระหว่างเชื้อราและสาหร่าย
หลากหลายพันธุ์
สิ่งหนึ่งที่สาหร่ายและเชื้อรามีเหมือนกันคือคำสองคำนี้ครอบคลุมสายพันธุ์ที่หลากหลาย ตัวอย่างเช่น เชื้อราไม่เพียงแต่รวมถึงเห็ดและเชื้อราที่มีขนาดใหญ่กว่าที่หลายคนคุ้นเคย แต่ยังรวมถึงพันธุ์ที่มีขนาดเล็กมาก เช่น ยีสต์ พันธุ์เหล่านี้มีอยู่เกือบทุกระบบนิเวศบนโลก
ในทำนองเดียวกัน สาหร่ายก็มีตั้งแต่สิ่งมีชีวิตขนาดเล็ก เช่น สิ่งมีชีวิตเซลล์เดียว ไปจนถึงสาหร่ายทะเลขนาดมหึมา ซึ่งสามารถเติบโตได้ยาวถึง 65 เมตร จากข้อมูลของพิพิธภัณฑ์ประวัติศาสตร์ธรรมชาติแห่งชาติสมิธโซเนียน มีตัวอย่างเกือบ 300,000 ตัวอย่างในคอลเล็กชันสาหร่ายของสหรัฐฯ เช่นเดียวกับเชื้อราที่กระจายอยู่ทั่วไปตามภูมิศาสตร์ สาหร่ายยังสามารถพบเห็นได้ทั่วโลกในสภาพแวดล้อมที่หลากหลาย รวมถึงสภาพแวดล้อมที่รุนแรงที่สุดในโลกด้วย
สภาพแวดล้อมที่ชื้น
เชื้อราและสาหร่ายต่างก็ชอบอยู่ในสภาพแวดล้อมที่ชื้น อันที่จริง ประโยชน์อย่างหนึ่งของสาหร่ายที่ได้มาจากความสัมพันธ์ของไลเคนที่อาศัยอยู่ร่วมกันกับเชื้อราคือความสามารถในการอยู่รอดบนบกในสภาพแวดล้อมที่ชื้น
แม้ว่าเชื้อราจะชอบสภาพแวดล้อมที่ชื้น แต่เชื้อราสามารถพบได้ในเกือบทุกสภาพแวดล้อม รวมถึงในทะเลทราย
สาหร่ายมักจะต้องการความชื้นมากกว่าเชื้อราเพื่อความอยู่รอด แท้จริงแล้ว สาหร่ายส่วนใหญ่พบได้ในสภาพแวดล้อมทางน้ำ เช่น ทะเลสาบและมหาสมุทร แม้ว่าจะพบได้ในสภาพแวดล้อมบนบกเช่นกัน
นิวเคลียสเดี่ยว
โดยทั่วไปแล้ว ทั้งเชื้อราและสาหร่ายเป็นตัวอย่างของสิ่งมีชีวิตที่มีนิวเคลียสเดี่ยว ซึ่งหมายความว่าพวกมันมีโครโมโซมแต่ละตัวเพียงชุดเดียว ในทางตรงกันข้าม สิ่งมีชีวิตแบบดิพลอยด์ เช่น มนุษย์และสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมส่วนใหญ่ มีโครโมโซมแต่ละตัวสองชุด