Strukturen för dubbelsträngat DNA är universellt i alla levande celler, men skillnader förekommer i metoderna för att extrahera genomiskt DNA från djur- och växtceller. Även om genomiskt DNA lever i cellkärnan beror mängden och renheten av extraherat DNA på cellens typ och storlek. Till exempel innehåller vissa celler mer DNA och orenheter än andra. Läs vidare för att lära dig mer om skillnader i DNA-extraktion.
Allmänt DNA-extraktion
Om du behandlar växt- och djurceller med ett tvålmedel kommer det att bryta ner lipiderna i cellen och kärnmembranen. Därefter kommer DNA-blandningen att separeras från cellmembran och proteiner. Därefter kan du använda alkohol för att fälla ut DNA i lösningen. Beroende på mängden i provet kan DNA vara synligt med blotta ögat. Tänk dock på att detta enkla förfarande inte nödvändigtvis producerar DNA med hög renhet.
Växt- och djurceller
Växtceller skiljer sig från djurceller på grund av sin styva cellvägg och organeller som kloroplasten. De innehåller också proteiner och enzymer som spelar en roll i fotosyntesen. Vissa växtceller har polyploidi, vilket innebär att de har mer än en kopia av varje kromosom per cell. Dessutom producerar cellulära processer som förekommer i växter såsom fotosyntes en rad sekundära metaboliter. Djurceller har ingen cellvägg, men behöver fortfarande kemikalier som natriumdodecylsulfat (SDS) för att störa cellmembranet för att frigöra genomiskt DNA.
Växt-DNA-extraktion
Växtgenom DNA är svårare att extrahera på grund av växtens cellvägg. Du kan ta bort den genom homogenisering eller genom att tillsätta cellulas för att bryta ner cellulosan som utgör cellväggen. Dessutom kan metaboliterna i växtcellen störa genomisk DNA-extraktion genom att förorena DNA-provet under utfällningsprocessen.
Djur-DNA-extraktion
Perifera leukocyter i blodet är den huvudsakliga källan till animaliskt genomiskt DNA, men provtagningen är svår eftersom blodet måste komma direkt från djuret. Blod innehåller en rad föreningar som proteiner, lipider, vita blodkroppar, röda blodkroppar, blodplättar och plasma, som kan förorena DNA-provet. Den primära föroreningen av animaliskt DNA som extraheras från blodprover är emellertid hem, vilket är den icke-proteinkomponenten i hemoglobin.
DNA-skillnaderna
Skillnaderna mellan växt- och djur-DNA ligger i sekvensen av baser i spiralen. Föreningar som finns i växtceller saknas i djurceller, och DNA-bassekvenser reflekterar detta. Dessutom är genomisk växt-DNA ofta större än djur-DNA. Dessa skillnader påverkar också extraktionsmetoder, utbyte och renhet av DNA.
