Neutrofila och acidofila heterotrofa bakterier utgör majoriteten av arterna av bakterier. Termerna "neutrofil" och "acidophilic" avser bakteriearters optimala pH-nivå - ett mått på ett ämnes surhet eller basitet. Till exempel mäter vinäger som surt och bakpulver som bas. PH-skalan varierar från 0 till 14, med 7, pH-värdet för rent vatten, mitt i mitten.
Neutrofila heterotrofer
Majoriteten av bakterier, neutrofiler, lever i jord eller vatten och växer bäst vid ett neutralt pH mellan 6 och 8. Om pH varierar för långt utanför detta intervall kan neutrofila bakterier inte överleva. De flesta bakterier som orsakar sjukdomar hos människor är också neutrofila heterotrofer, väl lämpade för att överleva i en människokropp.
Acidofila heterotrofer
Acidofila bakterier växer bättre vid lägre pH-nivåer, vanligtvis under pH 6, eftersom de har biologiska mekanismer som gör det möjligt för dem att hålla sitt inre pH nära neutralt. Syrgruvdränering - den förorenade, mycket sura avrinningen från gruvområden - innehåller en hög population av acidofiler som oxiderar sulfiden som finns i metallmalmer. Enligt Science Education Resource Center vid Carleton College uppvisade acidophile Ferroplasma som hittades i dränering av sura mineraler pH så låga som noll.
Obligatoriskt acidofila heterotrofer
Obligatoriska acidofiler kräver ett lågt pH, under 4 eller 5, för att överleva. Cellmembranet hos obligatoriska acidofiler löser sig faktiskt vid neutrala pH-nivåer, vilket orsakar celldöd. Många obligatoriska acidofiler är också termofiler - organismer som växer bäst vid höga temperaturer - och ofta i vulkaniska jordar. Thiobacillus ferrooxidans rankas troligen som den oftast studerade järnoxiderande acidofila bakterien.