Uttrycket genotyp hänvisar till den fullständiga genetiska sammansättningen av en organism. Det används också för att beskriva de olika variationerna av en gen, känd som alleler. Människor har två alleler för varje genetisk position, eller locus. Sammantaget betraktas varje par av alleler som en specifik genotyp.
Att känna till genotypen eller ett genotypsexempel på en individ kan vara viktigt för att förstå genetiskt uttryck, diagnostisera sjukdomar, lära sig om genetiska mutationer och mer.
Genotyp Definition
Låt oss börja med en specifik definition av genotyp. En individs genotyp är den ärftliga genetiska informationen som individen har. Detta hänvisar till dina gener, DNA, alleler, etc i ett allomfattande ord. Ett exempel skulle vara att beskriva en blommas färggenotyp som RR (vilket betyder att de har två "röda" alleler, RR, för sin färg) eller Rr (en "röd" allel, R och en "rosa" allel, r, för färg) .
Din fenotyp, å andra sidan, är vad och individuellt fysiskt visar som bestäms av genotypen de har. Medan två individer kan ha samma fenotyp kan de ha helt olika genotyper. Enligt blommeexemplet från tidigare verkar både RR- och Rr-blommorna vara röda eftersom rött är dominerande över rosa. De skiljer sig emellertid i sin genotyp eftersom en är homozygot (RR) och en är heterozygot (Rr).
Läs mer om definitionen, alleler och exempel på genotyper.
Att känna till genotypen: Punnett Square
En Punnett-torg är ett av de enklaste sätten att bestämma genotyp. Torget är faktiskt ett minikarta som används för att bestämma den potentiella genotypen för en avkomma med avseende på specifika egenskaper.
För att skapa en Punnett-kvadrat, skriv alla möjliga alleler över toppen av rutan för en förälder och alla möjliga alleler för den andra föräldern längst till vänster. Varje listad allel blir antingen en kolumn för toppalleler eller en rad för vänsteralleler inom torget. Kvadraten fylls i när du skriver ner alleler uppifrån i respektive kolumner och sedan skriv ner alleler från sidan i sina respektive rader och skapa en kvadrat full av potential genotyper.
Ett genotypsexempel som använder Punnett-torget är de klassiska ärtförsöken utförda av Gregor Mendel. Kolla in specifika genotypsexempel och Punnett rutor här.
Polymeraskedjereaktion
Polymeraskedjereaktion (PCR), som utvecklades under 1980-talet, genererar ett specifikt DNA-stånd baserat på en mallsträng. Förutom en mallsträng krävs DNA-polymeras, nukleotider och korta bitar av enkelsträngat DNA för en PCR-reaktion.
Vid en viss punkt börjar PCR-reaktionen att generera kopior exponentiellt, och endast under denna fas är det möjligt att bestämma den ursprungliga kvantiteten av målsekvensen i provet. Metoden används för sekvensering, kloning och genteknik.
Läs mer om skillnaderna mellan PCR-kloning.
Hybridiseringssond
En hybridiseringsprob används för att bestämma om en fysisk egenskap beror på genotyp. Processen börjar med fullständig nedbrytning av DNA som ska analyseras följt av dess överföring till ett filtermembran. Därefter tillsätts sonden till filtret och får binda till en målsekvens.
Efter cirka 24 timmar tvättas filtret för att avlägsna eventuell icke bunden sond. En hybridiseringsprob kan också användas för att bestämma effektiviteten av en kloningsprocess eller för att ta reda på antalet kopior av en specifik gen.
Direkt DNA-sekvensering
Human Genome Project ledde till utvecklingen av ett antal kraftfulla DNA-sekvenseringsverktyg. Förutom att avkoda hela genomet Homo sapiens, har dessa verktyg gjort det möjligt för forskare att sekvensera hela genomer från många andra organismer, inklusive möss, råttor och ris. Toppmoderna sekvenseringsverktyg gör det möjligt för dagens genetiker att jämföra och manipulera stora mängder DNA snabbt och billigt.
Detta gör det möjligt att bestämma genetikens roll i sjukdomskänslighet, organismernas genetiska svar på miljöstimuli och spåra utvecklingen av ett drag eller en art, enligt National Human Genome Research Inleda.