Processen att producera protein från en DNA - deoxiribonukleinsyrasekvens innehåller två huvudsteg: transkription och translation. Under transkriptionen skapas en budbärarribonukleinsyra, eller mRNA, från DNA-mallen. Detta mRNA kombineras med ett ribosomalt RNA, känt som rRNA, och överför RNA, eller tRNA, komplex för att översätta mRNA-koden till en aminosyrasekvens, ett protein. DNA består av en sekvens av nukleotidbaser. De fyra baserna är adenin, tymin, guanin och cytosin. Sekvensen i vilken dessa baser förekommer på en DNA-sträng kodar slutligen för produktion av vissa proteiner. Efter att cellen har tillverkat proteinerna kan de användas strukturellt eller i olika metaboliska processer.
Skapa ett mRNA-transkript av DNA-sekvensen. Varje bas i DNA matchar en annan bas. Bilder av DNA visar det vanligtvis i en dubbel helix, med baserna på en tråd som förbinder via bindningar till de kompletterande baserna på motsatt tråd. Kompletterande baser är: adenin (A) och tymin (T) och cytosin (C) och guanin (G). Så om en DNA-sträng läser A-C-G-C-T-A, är den komplementära strängen T-G-C-G-A-T. Du kan hitta sekvensen för mRNA-transkriptet på samma sätt genom att använda komplementen till baserna som visas i DNA-sekvensen. RNA innehåller emellertid inte bastymin (T); istället ersätts denna bas med uracil (U). När du stöter på en adenin (A) i DNA-sekvensen, matcha den med en uracil (U).
Om DNA-sekvensen är A-A-T-C-G-C-T-T-A-C-G-A, är mRNA-sekvensen U-U-A-G-C-G-A-A-U-G-C-U.
Skapa en tRNA-antikodonsekvens från mRNA-transkriptet. Varje tRNA har en uppsättning av tre baser på den känd som ett anti-kodon. Antikodonet matchar komplementära baser i mRNA-sekvensen. För att bestämma den övergripande anti-kodonsekvensen som kommer att matcha en mRNA-sträng, transkriberar du helt enkelt RNA-sekvensen; med andra ord, skriv ut de kompletterande baserna. Med användning av den tidigare noterade mRNA-sekvensen är tRNA-anti-kodonsekvensen A-A-T-C-G-C-U-U-A-C-G-A.
Bryt upp tRNA-sekvensen i tre basuppsättningar. Eftersom anti-kodoner består av tre baser åt gången, är AAT-CGC-UUA-CGA ett bättre sätt att skriva anti-kodonsekvensen A-A-T-C-G-C-U-U-A-C-G-A.
Tips
-
Du kan hitta antikodonsekvensen ännu snabbare genom att helt enkelt skriva DNA-sekvensen med U för uracil istället för T för tymin. Dela sedan sekvensen i de tre bas-antikodonerna.
Du kan använda antikodonsekvensen för att matcha de proteiner som tillsätts av varje tRNA under translation och skapa en aminosyrasekvens. Kontrollera dock att det aminosyrareferensdiagram du använder är för antikodoner, (se Resurser). Många aminosyrasekvenseringsdiagram listar helt enkelt matchande mRNA-kodoner istället för tRNA-antikodoner, så att du kan hoppa över steget att bestämma antikodonsekvensen.
Sekvensen för tRNA-molekylen är helt enkelt en RNA-transkription av DNA-sekvensen som används för att skapa den.