Hur man beräknar den isoelektriska punkten för peptider

Peptider är korta polymerfragment sammansatta av aminosyror. Varje peptid har en viss aminosyrasekvens betecknad med en kod med tre bokstäver eller en bokstav; till exempel förkortas aminosyran alanin som "Ala" eller "A." Laddningen av peptiderna i lösningen beror på lösningens surhet. Den isoelektriska punkten (pI) avser lösningens surhetsvärde vid vilken peptidmolekylen har nettoladdningen noll. Lösligheten för peptiden är minimal vid den isoelektriska punkten. Använd tillgängliga webbservrar för att beräkna pI-värdet för en peptidaminosyrasekvens.

Skriv peptidsekvensen med enbokstavskoden. Till exempel, om en peptid har en aminosyrasekvens Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (Alanin — Serin — Glumatinsyra — Leucin — Proline), då är sekvensen med en bokstav "ASELP". Om det behövs, se omvandlingstabellen med tre bokstäver till en bokstav som anges i Resurser.

Använd till exempel vilken webbläsare som helst, Internet Explorer eller Firefox för att navigera till en server som beräknar peptidens isoelektriska punkt (pI); se Resurser.

instagram story viewer

Läs det isoelektriska punktvärdet (pI) som ges i raden "Teoretisk pI / Mw." I vårt exempel är pI 4,00. Observera att servern beräknar också peptidens molekylvikt (Mw).

Om författaren

Oxana Fox är en frilansskribent som specialiserat sig på medicin och behandling, programvara och hårdvara, digital fotografering och finansiella tjänster. Hon tog examen från Moscow Medical College 1988 med formell utbildning i barnläkare.

Fotokrediter

Comstock Images / Comstock / Getty Images

Teachs.ru
  • Dela med sig
instagram viewer