Relationer mellan olika djur etableras genom taxonomi. Taxonomi är klassificeringen av levande saker. Dessa klassificeringar är uppdelade enligt följande från den största grupperingen till en enskild djurart: Rike, fylium, underfolie, klass, ordning, familj, släkt, art. Djur som är av samma art är mycket nära släkt och djur i samma rike är mycket avlägset släkt. Till exempel är alla djur en del av ett rike, Animalia, och alla växter finns i riket Plantea.
Alla spindlar och krabbor finns i phylum Arthopodia, liksom alla insekter. Arthropods kännetecknas fysiskt av det faktum att de alla har segmenterade, fogade ben och har ett exoskelett. Medan både krabbor och spindlar är grupperade i samma fylym betyder det inte att de nödvändigtvis är nära besläktade. Till exempel är alla djur med en ryggrad i stammen Cordata. Men det är uppenbart att även om fiskar och apor båda har ryggar är de mycket olika.
Fördelningen mellan spindlar och de flesta krabbor sker på subphylumnivå. Spindlar finns i subphylum Cheilcerata, medan de flesta krabbor är i subphylum Mandibulata. Skillnaden är till stor del att krabbor har en underkäke, en typ av käke och spindlar har chelicerae, som är mundelar som dyker upp framför munnen. Spindlarnas "huggtänder" är chelicerae.
Hästskokrabbor finns i samma underfyl som spindlar, Cheilcerata. Detta gör hästskokrabbor närmare besläktade med spindlar än de är till andra krabbor. Liksom spindlar har hästskokrabbor inte underkäken och har istället chelicerae framför munpartierna. Spindlar och hästskokrabbor är uppdelade på klassnivå. Spindlar är i klassen Arachnida, medan hästskokrabbor är i klassen Merostomata.
En annan skarp varelse brukade existera och klassificeras också i subphylum Cheilcerata. Dessa kallas ”havsskorpioner”. De utrotades för cirka 250 miljoner år sedan. Dessa "skorpioner" hade en större sting på baksidan av svansen och växte till större än 6 fot i längd. Detta gör dem möjligen till den största leddjur som någonsin levt. Deras inkludering i understammen Cheilcerata gör att dessa forntida galna skorpioner också är närmare besläktade med spindlar än krabbor.