Sex underarter av mulehjort bor i ungefär 88.000 kvadratkilometer eller drygt hälften av Kaliforniens länder. De colombianska svartstjärthjortarna, Rocky Mountain-mulehjortarna och de Kaliforniska mulehjorten ligger i spridda livsmiljöer över statens norra län. Alla sex underarter ser väldigt lika ut med endast små skillnader i pälsfärg och markeringar.
Columbian Black-Tailed Deer
Columbian black-tailed hjortar är de vanligaste underarterna i Kalifornien. De förekommer i mycket av norra Kalifornien, i kustområden från Oregon-gränsen till Santa Barbara-länet och inåt landet till den västra sluttningen av Cascade-Sierra Nevada Range. Några av dessa befolkningar är vandrande och spenderar somrar i bergen och vintrar på lägre höjder. Andra, särskilt de nära kusterna, är boende året runt. Sann mot sitt namn har colombianska svartstjärtade hjortar helt svarta svansar och en relativt liten gumplapp
Rocky Mountain Mule Deer
Rocky Mountain mule hjortar, den tredje vanligaste underarten i staten, förekommer främst öster om Cascade-Sierra Nevada Range i Lassen, Shasta, Siskiyou och Modoc län. De tillbringar vanligtvis vintrar i Great Basin Desert och matar på bitterbrush och sagebrush. På sommaren reser de uppåt 50 luftmiljoner till höga höjder i bergen. Rocky Mountain mule hjort är bland de största av underarterna och har som regel de största hjorthornen. De har en stor, vit gummilapp och en svans som bara är svart i spetsen.
Kalifornien Mule Deer
Den näst vanligaste underarten i staten, Kaliforniens mulehjort, sträcker sig längs den västra sluttningen av Sierra Nevada, liksom i bergen San Bernardino, San Gabriel och Tehachapi. Både bosatta och flyttande befolkningar förekommer. Mulehjort i Kalifornien har en större gumpplåster och mindre svart i svansen än den colombianska svartstjärthjorten. Svansen kan tyckas ha en svart linje som sträcker sig längden. De förväxlas ofta med södra mulehjort, som har en betydligt större svartremsa.
Hybrider
Eftersom de är av samma art kan Kaliforniens underarter av muldjurshjort lätt och blandas när de kommer i kontakt med varandra. I kustområden söder om San Francisco Bay-området hybridiserar Kaliforniens mulehjort i stor utsträckning med colombianska svartstjärthjort.
