Regnskogsekosystem ger ett hem för några av de mest täta och olika djursamhällen på jorden. Regnskogar utnyttjas emellertid ständigt för sina rika resurser. Mänskliga metoder som gruvdrift och avskogning har allvarliga effekter på dessa livsmiljöer och orsakar otaliga djurarter att förlora sina hem i en alarmerande takt.
Fåglar
Flera arter av tukaner, papegojor och andra tropiska fåglar i de södra och centralamerikanska regnskogarna hotas med utrotning på grund av avverkning och andra orsaker till avskogning. Harpy eagle, en av de största kända örnarterna världen över, trivs i tropiska regnskogslågar från södra Mexiko till östra Bolivia; denna fågels livsmiljö krymper ständigt på grund av tydliga avskogningsmetoder samt förstörelsen av häckningsplatser från industriella metoder som gruvdrift och oljeborrning. Habitatförlust hotar också tusentals flyttfågelarter. Dessa arter reser norrut under den nordamerikanska sommaren och tillbaka till tropikerna under vintern; fler och fler återvänder varje år för att inte hitta något hem och / eller förstörda häckningsplatser.
Däggdjur
Ett brett utbud av däggdjursarter tappar sina hem i regnskogen, från den minsta gnagaren till den största rovdjuret. Många större däggdjur behöver gott om plats för foder och / eller jakt. När industriell praxis utvecklas i vissa områden måste regnskogspattedyr som gorillor, jaguarer och pumor begränsa sig till fragmenterade livsmiljöer med otillräckliga resurser. Avskogning påverkar arborealt däggdjur mest direkt (de som bor i träden), såsom flygande ekorre och fruktfladdermus, liksom flera arter av apor. Hela samhällen lämnas hemlösa och tvingar dem att anpassa sig till trädlösa miljöer som de inte är förberedda för.
Reptiler och amfibier
Avskogning är den främsta orsaken till förlust av livsmiljöer för de flesta regnskogs reptiler, medan många arter av amfibier också tappar sina hem på grund av oljeborrning och gruvmetoder som förorenar dammar, floder och vattendrag, vilket tvingar dem att hitta nya vattenkällor för deras halvkvatiska livsstil. Hotade och hotade reptiler och amfibier innefattar den gyllene paddan, Madagaskar-daggecko och leguaner, liksom flera arter av giftpaddor, särskilt de i Colombia.