Beläget delvis i norra Anderna, med kustlinjer vid både Stilla havet och Karibiska havet, Colombias unika geografi ger fem mycket distinkta ekosystem inom dess gränser: alpintundra, eller paramo; regnskog; höghöjd molnskogar; kustregioner; och slätter - eller los llanos. Eftersom Colombia ligger så nära ekvatorn, går det inte igenom betydande säsongsvariationer.
Paramos
Paramos är tropiska ekosystem med hög höjd som just börjat förstås av det vetenskapliga samfundet. Forskning har visat att dessa unika ekosystem genererar nya arter snabbare än något annat ekosystem på jorden. De colombianska parametrarna är hem för 68 arter av frailejones, blommande växter som fångar upp vatten från dimma. Tillsammans med ekosystemets lavar och mossa filtrerar och reglerar frailejones vatten som så småningom passerar ner i Columbia nedre höjder. I colombianska paramos finns också cirka 5000 andra unika växtarter.
Molnskogar
Precis nedanför parametrarna i höjd sitter Colombias molnskogar. Dessa skogar ingår i landets nationalpark Las Orquídeas, uppkallad efter mer än 200 arter av orkidéer som finns där. Molnskogarna innehåller också många andra arter som är infödda i Colombia, inklusive arter av jaguar, puma, apa, rådjur, fåglar, fladdermöss och insekter. Molnskogarna är också hem för den hotade glasögonbjörnen. Forskare tror att klimatförändringarna kan påverka björns favoritväxter att äta - tvingar dem att söka hårdare och längre efter mat och eventuellt sätta dem i konkurrens med andra arter.
Amazonas regnskog
Cirka en tredjedel av Colombia täcks av Amazonas; Precis som resten av världens största regnskog är det här området hem för många unika arter. År 2013 avslöjade forskarna upptäckten av två nya arter i den colombianska Amazonas: Cercosaura hypnoides och Callicebus caquetensis. Cercosaura hypnoides är en liten svart ödla som tros vara hotad och Callicebus caquetensis är en av cirka 20 arter av titi-apor som lever i Amazonas. När dessa apor är spädbarn visar de sin nöjdhet och tillgivenhet genom att spinna, som kattungar.
Kustregioner
Kustregionerna i Colombia sitter vid gränserna för vattenlevande och markbundna ekosystem och är främst hem för mangroveskogar. På grund av den höga mängden nedbrytande organiskt material är det ett stort antal fiskar i dessa kustekosystem. Mangroveskogarna innehåller många arter av mangrover samt en växande population av marina musslor och blötdjur; lokalsamhällen skördar ofta musslan som kallas piangua hembra. Ett antal däggdjur bor i dessa mangroveskogar, inklusive tigerkatter, nutria och vilda svin som kallas "tatabro".
Los Llanos (Plains)
Gräsmarkerna, eller Los Llanos, sitter främst runt floden Orinoco, som ligger inbäddat mellan Colombia och Venezuela. Själva floden är hem för den infödda och utrotningshotade Orinoco-krokodilen, som har varit känd för att nå 23 fot i längd. Orinoco-sköldpaddan, jätteuttern, jätte bältdjur och svart-och-kastanjörn är andra hotade arter av Los Llanos. Slätterna är också värd för många flyttfåglar, såsom gulben och flera arter av sandpiper.