Бактерије су мали једноћелијски организми који су и корисни и штетни за људе. Неки облици бактерија помажу нам да живимо, попут оних који помажу у разградњи хране у нашим цревима. Други облици, попут бактерија које узрокују бубонску кугу, могу да убију човека ако се не лечи. Постоји много различитих врста бактерија и оне се одмашу користећи различите методе. Две основне методе бактеријског дисања су аеробно дисање и анаеробно дисање.
Аеробно респираторни облици бактерија захтевају кисеоник да би живели. Кисеоник користе као гориво како би помогли сагоревању енергије и обезбедили им енергију потребну за живот. Ова врста бактеријског дисања је иста врста коју користе људи, па отуда и израз „аеробно вежбање“. Главни нуспродукт аеробног дисања бактерија је угљен-диоксид.
Многе врсте бактерија анаеробно дишу. Другим речима, могу да прођу кроз процес дисања без присуства кисеоника. Уместо да користе кисеоник да им помогну да сагоре енергију у храни, ове врсте бактерија користе друге хемикалије које се природно јављају да би створиле хемијске реакције и ослободиле енергију која им је потребна. Уобичајене хемикалије које се природно јављају су нитрати, сулфати и угљен-диоксид. Анаеробно дисање код бактерија генерално ствара многе нуспроизводе. Многи од ових нуспроизвода могу бити токсични или опасни за људе и укључују етанол и водоник.