Термин генотип односи се на комплетну генетску структуру организма. Такође се користи за описивање различитих варијација гена, познатих као алели. Људи имају два алела за сваки генетски положај или локус. Узето заједно, сваки пар алела сматра се одређеним генотипом.
Познавање генотипа или примера генотипа појединца може бити важно за разумевање генетске експресије, дијагнозу болести, учење о генетским мутацијама и још много тога.
Дефиниција генотипа
Почнимо са одређеном дефиницијом генотипа. Генотип јединке је наследна генетска информација коју та јединка има. То се једном свеобухватном речју односи на ваше гене, ДНК, алеле итд. Пример би био описивање генотипа боје цвета као РР (што значи да имају два „црвена“ алела, РР, за своју боју) или Рр (један „црвени“ алел, Р и један „ружичасти“ алел, р, за боју) .
С друге стране, ваш фенотип је оно што појединац физички показује што је одређено генотипом који имају. Иако две јединке могу имати исти фенотип, могле би имати потпуно различите генотипове. Следећи пример цвета из ранијег, изгледало би да су и РР и Рр цветови црвени јер је црвена боја доминантна у односу на ружичасту. Међутим, они се разликују по свом генотипу, јер је један хомозигот (РР), а хетерозигот (Рр).
Прочитајте више о дефиницији, алелима и примерима генотипова.
Познавање генотипа: Пуннетт Скуаре
Пуннеттов квадрат је један од најједноставнијих начина за одређивање генотипа. Квадрат је заправо мини карта која се користи за одређивање потенцијалног генотипа за потомство с обзиром на одређену особину.
Да бисте креирали Пуннеттов квадрат, на левој страни напишите све могуће алеле преко врха квадрата за једног родитеља и све могуће алеле за другог родитеља. Сваки наведени алел постаће или колона, за горње алеле, или ред, за алеле са леве стране, унутар квадрата. Квадрат се попуњава док у врху колоне записујете алеле, а затим запишите алеле са стране у њихове редове, стварајући квадрат пун потенцијала генотипови.
Пример генотипа који користи Пуннеттов квадрат су класични експерименти на зрну грашка које је изводио Грегор Мендел. Погледајте конкретне примере генотипа и Пуннетт квадрата овде.
Полимеразе Ланчана реакција
Развијена током 1980-их, ланчана реакција полимеразе (ПЦР) генерише специфично стајалиште ДНК засновано на ланцу шаблона. Поред шаблона шаблона, за ПЦР реакцију неопходни су ДНК полимераза, нуклеотиди и кратки делови једноланчане ДНК.
У одређеном тренутку, ПЦР реакција почиње да генерише копије експоненцијално, и само током ове фазе могуће је одредити оригиналну количину циљне секвенце у узорку. Метода се користи за секвенцирање, клонирање и генетски инжењеринг.
Прочитајте више о разликама између ПЦР клонирања.
Сонда за хибридизацију
Сонда за хибридизацију користи се да би се утврдило да ли је нека физичка карактеристика последица генотипа. Процес започиње потпуним варењем ДНК која се анализира, након чега следи њен пренос на мембрану филтра. Затим се сонда дода у филтер и остави јој да се веже за циљну секвенцу.
После отприлике 24 сата, филтер се опере да би се уклонила сва невезана сонда. Испитивање хибридизације такође се може користити за одређивање ефикасности процеса клонирања или откривање броја копија одређеног гена.
Директно секвенцирање ДНК
Пројекат хуманог генома довео је до развоја великог броја моћних алата за секвенцирање ДНК. Поред декодирања комплетног генома Хомо сапиенс, ови алати омогућили су научницима да секвенцирају комплетне геноме бројних других организама, укључујући мишеве, пацове и пиринач. Врхунски алати за секвенцирање омогућавају данашњим генетичарима да упоређују и манипулишу великим количинама ДНК брзо и јефтино.
То ће омогућити утврђивање улоге генетике у осетљивости на болести, генетском одговору организама на подстицаји из окружења и праћење еволуције неке особине или врсте, према Националном истраживању хуманог генома Институт.