Алел је могућа кодирајућа секвенца гена. Уобичајена заблуда или погрешна терминологија је да постоје гени за одређене особине. Гени контролишу различите особине организма, као што су боја косе или боја очију, али стварни израз особине зависи од тога који је алел доминантан. На пример, ген за боју очију код људи може имати алел за смеђе очи и алел за плаве очи, или алел за смеђе очи и један за зелене очи. Људи, као и други облици живота који имају по две копије сваког хромозома, такође имају по две копије сваког гена за чување алела.
Две копије гена, по једна на сваком од хромозома, садрже по један алел. Хомозигозност се јавља када две копије гена садрже исти алел за одређени фенотип или изражену особину. Хетерозигозност се јавља када се два алела разликују. Фенотипи могу бити доминантни или рецесивни. Ако је фенотип доминантан, мора бити присутан само један од алела за њега. Ако је рецесиван, оба алела морају бити присутна.
Према Државном уреду за образовање у држави Утах, Пуннеттов квадрат се може користити за предвиђање вероватноће да ће се одређени генотип појавити у потомства узимањем алела два родитеља и њиховим комбиновањем њих. Генотип ће утицати на фенотип, у зависности од тога да ли су алели доминантни или рецесивни. Основни Пуннеттов квадрат подељен је на четири мања квадрата. Могући гени једног родитеља наведени су изнад горња два квадрата, а други поред њега иде вертикално низ леву страну. Велика слова означавају доминантне алеле, а мала слова рецесивне алеле. На пример, хомозиготни доминантни ген за смеђе очи написао би се као ББ, а хетерозиготни као Бб. Хомозиготни рецесивни ген би се написао као бб. Узимањем слова поред сваког квадрата, за крст Бб к Бб вероватноћа ББ генотипа била би 25 процената, Бб 50 процената и бб 25 процената. У погледу фенотипа, потомци имају 75 посто шансе да имају смеђе очи, јер су смеђе очи доминантан фенотип, наводи сциенцекидсатхоме.цом.