Присуство многих једноланчана антитела која се везују за ДНК често су резултат аутоимуних реакција или вирусних инфекција. Аутоимунитет описује ситуацију у којој здраве ћелије тела напада сопствени имунолошки систем. Постоји преко 80 различитих аутоимуних болести код људи, али разлог зашто се јављају је непознат. Међутим, можда постоји генетски фактор јер се аутоимуне болести обично јављају у породицама
Б Ћелије
Антитела производе имуне ћелије назване Б лимфоцити (Б ћелије). Антитело је протеин који препознаје и држи се страних честица. Антитела служе многим функцијама, укључујући хватање и одмеравање страних честица и везивање за стране освајаче, тако да друге имуне ћелије знају ко су освајачи. Свако антитело препознаје само одређену врсту страних честица, било да се ради о молекулу протеина, молекулу шећера, молекулу масти или молекулу ДНК. У аутоимуним болестима нападају се здраве ћелије особе и ослобађа се ДНК унутар тих ћелија. Б ћелије проналазе ову ДНК и мисле да припада страном освајачу. Б ћелије тада производе антитела која се везују за ову ДНК. То се обично не би требало догодити, па присуство високог нивоа антитела против једноланчане ДНК може указивати на аутоимуну болест.
Мултипла склероза
Мултипла склероза (МС) је најчешћи онеспособљавајући неуролошки поремећај код младих одраслих. Резултат је напад на имуне ћелије тела на нервне ћелије у мозгу и кичмену мождину. Кластери различитих типова имуних ћелија, укључујући Б ћелије, могу се наћи у околним плаковима, који су региони напада у мозгу и кичменој мождини. Како антитела на ДНК утичу на нормалне ћелије у МС? Нормалне ћелије складиште своју ДНК унутар свог језгра, које је дубоко у ћелији. Антитела не могу проћи кроз спољну мембрану ћелије, па се не могу везати за ДНК која се налази унутар језгра. Међутим, ћелије имају одређену ДНК која је причвршћена за спољну површину у облику онога што се назива ДНК-хистонски комплекси. Анти-ДНА антитела која производе Б ћелије нападају здраве ћелије причвршћивањем на ову површинску ДНК.
Системски еритематозни лупус
Системски еритематозни лупус (СЛЕ) је аутоимуна болест код које имуни систем напада многе органе, укључујући бубреге, кожу и мозак. Оштећење бубрега је најважнија карактеристика СЛЕ која утиче на дугорочно преживљавање пацијента. Утврђено је да антитела против ДНК везују зид гломерула, који је филтрациона сијалица на почетку филтрационе цеви у бубрегу. Бубрег има много ових филтрационих епрувета, које филтрирају отпадне производе из крвотока. Антитела против ДНК не везују се само за ДНК која је на површини ћелија која облаже гломерул, већ се везују и за молекуле шећера на овој површини. Ћелије гломерула имају молекул шећера назван хепарин-сулфат, који привлачи антитела против ДНК.
Вирусна инфекција
Хепатитис Б је једноланчани ДНК вирус, што значи да су генетске информације које он носи у облику једноланчане ДНК. Хепатитис Б узрокује оштећење јетре и рак јетре код многих људи широм света. Истраживања су показала да људи заражени хепатитисом Б производе антитела против једноланчане ДНК овог вируса. Количина ових антитела која тече у крвотоку особе може се користити за дијагнозу да ли је та особа заражена.