Фотосистеми користе светлост за енергију електрона, који се затим користи у ланцу транспорта електрона за стварање високоенергетских молекула за употребу у мрачним реакцијама фотосинтезе. Такве реакције су познате као фотофосфорилација и представљају фазу лагане реакције фотосинтезе.
Фотосистеми су сложени аранжмани хлорофила а са другим пигментима, укључујући хлорофил б, ксантофили и каротеноиди, који хватају светлосну енергију за енергију електрона уклоњеног из воде молекула. У биљкама се фотосистеми налазе у тикалоидној мембрани унутар хлоропласта. Две врсте фото-система идентификоване су као фото-систем И и фото-систем ИИ.
П680 је облик хлорофила који се користи у фотосистему И, а електрон се транспортује из пигмената у протеин ферредоксин. Биљке поред фотосистема ИИ имају и фотосистем И.
П700 је облик хлорофила који се користи у фотосистему ИИ, а електрон се транспортује до молекула пластохинона. Многе фотосинтетске бактерије имају само фотосистем ИИ. Цијанобактерије су значајан изузетак јер имају обе врсте фотосистема.
У цикличној фотофосфорилацији, енергизовани електрон који ослобађа фотосистем и користи се у ланцу транспорта електрона враћа се у фотосистем И. Овај процес производи АТП.
У нецикличној фотофосфорилацији, електрон прелази из фотосистема ИИ кроз низ реакција на фотосистем И, који поново енергизира електрон користећи светлост за другу серију реакција. Електрон се не враћа у фотосистеме и ствара се НАДПХ.