Семе биљака је затворено у спољној љусци различите дебљине. Љуска штити сићушни ембрион изнутра од паразита, повреда или екстремних температура. Унутар љуске налази се и ендосперм, храна која храни ембрион током раних фаза гајеног семена упија воду, активирајући биохемијске механизме потребне за клијање и раст. Након што упије довољно воде, ембрион пукне спољну љуску семена и појављује се мала, растућа биљка.
Дебљина слоја семена
•••Бранд Кс Пицтурес / Бранд Кс Пицтурес / Гетти Имагес
Тврда љуска или облога на неким семенима дизајнирана је да спречи доспевање воде у семе, спречавајући тако ембрион изнутра да добије воду потребну за активирање механизма раста. Пример семена са тврдом спољном љуском је дрво кафе Кентуцки Гимноцладус диоица. Тврди семенски омотачи омекшавају када су натопљени водом или када је земљиште стално влажно, али уколико не постоји начин да се вода доведе до семена, они могу угинути пре него што икад проклијају.
Танки слојеви семена уклањају водену баријеру. Светлост продире у слојеве танког биљног ткива, а када пигмент фитохром упије светлост, ембрион се мења на такав начин да излази из танке семенске облоге. Танко обложеним семенима је потребна вода како би могла да упију храну из тла.
Ницкинг Сеед Цоатс
•••Медиоимагес / Пхотодисц / Валуелине / Гетти Имагес
Скарификација је поступак уситњавања тврдо пресвучених семена ради уклањања малог дела спољне љуске. То омогућава води да уђе у то подручје и дође до ембриона. Што више воде ембрион апсорбује, то више набубри, на крају пукнувши целу тврду спољну шкољку након клијања. Никање такође омогућава да се види да ли је семе одрживо, јер се одрживо семе чини белим испод његове облоге. Ако се након ницања семена не види бело, семе није одрживо. Семе које је подрезано требало би да никне у року од две недеље; без пуцања можда никад неће никнути.
Недовољан развој семена
Када се ембриони нису у потпуности развили, семе мора сазрети даље пре него што ембрион може никнути. Без ускладиштених хранљивих састојака унутар семена, оно се не може развити. Семе орхидеја није веће од честица прашине и има само по један ембрион у сваком семену. Овим ембрионима је потребна храна попут гљивица из земље како би помогли у развоју док не продру у семенску облогу. Вода омогућава семену да апсорбује хранљиве састојке из земљишних гљивица, али такође омекшава превлаку семена. Будући да ово семе има ограничену одрживост, унутрашњи ембрион ће умрети без брзе везе између гљивица у земљи и семена, што је процес који омогућава вода.
Како долази до клијања
•••Зедцор у целости / ПхотоОбјецтс.нет / Гетти Имагес
Први знак клијања је апсорпција пуно воде, активирајући метаболичке функције потребне за клијање и раст. Након упијања довољно воде, ембрион постаје превелик за семе и пуца спољна љуска; израња мала биљка. Врх корена је први део ембриона који се појављује и он усидра семе у земљу, омогућавајући ембриону да и даље упија хранљиве материје и воду из тла. Будући да је коренима нових ембриона потребна вода, сејте семе дубље у земљу током најтоплијег дела лета. То омогућава семену и клијалом ембриону да добију довољну количину воде јер се горња земља тако брзо исушује.