Инкубирати значи одржавати задату температуру. Инкубација паткиног јајета је временски период између када се јаје загреје на тачну температуру након полагања и када се излеже. Инкубација је период развоја ембрионалне патке унутар јајета.
Према Одељењу за науку о животињама на Државном универзитету у Оклахоми, већина домаћих врста патки, попут патке Пекин, инкубира се 28 дана до излегања. Мошусним паткама је потребно 35-37 дана.
Дивље патке такође инкубирају своја јаја око 28 дана. Пошто је женској патки потребно неколико дана да произведе сва јаја, она неће почети да „седи“ на гнезду да инкубирају јаја до полагања последњег јаја, како би се осигурало да се излегу отприлике у исто време као и свако друго.
Мелвин Л. Хамре, научник за животиње са Проширеног уреда Универзитета у Минесоти, каже да се јаја морају окретати 3 до 5 пута дневно, до три дана пре него што се излегу. Патка јаја могу захтевати већу влажност од пилећих јаја током инкубације, и могу добро проћи свакодневно прскање млаком водом. Ово повећава губитак влаге на мембранама јаја, омогућавајући већи ваздушни џеп унутар јајета.
Развој паткиног ембриона може се зауставити око недељу дана пре инкубације држањем јаја на температури од 55 до 60 Ф (13-15 Ц). Развој ембриона не започиње док се јаје не загреје на тачну температуру. Период инкубације започиње када јаје достигне одговарајућу температуру од 37,5 Ц.