У цветним биљкама женске репродуктивне структуре које производе семе налазе се у плодовима цвећа. Карпал се састоји од стигме, стила и јајника. Јајник садржи овуле (јајашца) која постају семе након што се оплоде.
Семе настаје када мушке полне ћелије садржане у полену дођу у контакт са женским полним ћелијама (овулама) кроз процес који се назива опрашивање. Многе биљке се ослањају на животиње опрашиваче, попут пчела или лептира, да би пренијеле полен из прашника једног цвијета у жигове другог цвијета. Из стигме, полен путује цевастом структуром која се назива стил у јајник где се врши оплодња овула. Једном оплођени, овули прерастају у семе.
Ангиосперме су највећа и најчешћа група семенских биљака. Ангиосперме су васкуларне биљке које дају и цвеће и плодове. Плод критосеменке затвара семе, пружајући храну и заштиту растућем ембриону. Примери критосеменки укључују кукуруз, пшеницу, руже и дрвеће јабука.
Гимносперме су васкуларне биљке које носе „голо“ семе - односно семе које није затворено у плоду. Најпознатија група голосјемењача су четинари (као што су борови и јеле.) Сјеме четинара се налази у шишаркама умјесто цвијећа.