Хондурас је друга по величини држава у Централној Америци, простире се преко превлаке од Кариба до Тихог океана. Упркос агресивној сечи шума, Хондурас и даље одржава више пошумљеног подручја од већине других земаља у региону. Неколико врста шума доминира пејзажом, укључујући облачну шуму, борову шуму, кишну шуму и мангрове. Биљне и животињске врсте обилују разноликим шумским екосистемима Хондураса, укључујући врсте које су нестале из остатка региона. Више од једног уточишта за дивље животиње у Хондурасу издвојено је ради заштите разноликости живота у том подручју.
Сисари у Хондурасу
У шумама Хондураса налази се више од 200 врста сисара. Међу хондурашким животињама је и неколико ретких створења. Слепи мишеви (Цхироптера) чине скоро половину сисара у земљи са 98 познатих врста које заузимају сваки шумски екосистем. Иконски јагуар (Пантхера онца) једна је од најређих врста у целој Централној Америци. Најчешће виђени у областима мангрова, јагуари су угрожена врста у Хондурасу. Западноиндијске морске краве (Трицхецхус манатус), некада честе дуж карипске обале Хондураса, сада се ретко могу видети, осим у удаљеним областима мангрове. Национална животиња Хондураса, белорепи јелен (Одоцоилеус виргинианус), највећа је врста јелена у земљи. Најчешће виђен у низинама и боровим шумама, белорепан је заштићена врста. Широк спектар мајмуна се такође налази у Хондурасу, укључујући капуцине са белом главом (Цебус цапуцинус), Мексички мајмун паук (Ателес геоффроии веллеросус) и мајмун завијајући златом огртачем (Алоуатта паллиата паллиата).
Обиље птица
Хондурас има изузетно богату разноликост врста птица. Постоји 18 врста папагаја, укључујући наранџасто-парадасти папагај (Бротогерис југуларис), сјајну зелену ара (Ара амбигуа), пацифичка пацифика (Аратинга стренуа) и гримизна ара (Ара мацао), која је национална птица Хондураса. Нађена у тропским шумама на великим надморским висинама, ластавица са црним капама (Нотиоцхелидон пилеата) је птица селица која је честа у Хондурасу. Кестен-мандибулирани тукан (Рампхастос сваинсонии) чест је призор у обалним низијским шумама Хондураса. Познати по свом јарко обојеном лицу и претјераном новцу, понекад их држе као кућне љубимце, иако су заштићена врста.
Тропско дрвеће
Сваки шумски екосистем има кључну врсту, што значи да једна врста дефинише тип шуме. У Хондурасу дрвеће црне мангрове (Авиценниа герминанс) и црвене мангрове (Рхизопора мангле) указују на границе екосистема мангрове. Дрвеће махагонија (Свиетениа мацропхилла) понекад се меша са врстама мангрова на сувом, што указује на почетак приморских низијских борових шума. Хондураски бор (Пинус царибаеа вар. хондуренсис) и окотни бор (Пинус ооцарпа) су једине две врсте бора у земљи, иако доминирају огромним трактима низијских шума. Једно од најупечатљивијих стабала у Хондурасу је цеиба (Цеиба пентандра). Понекад се назива капок, то је масивно дрво које може достићи висину од 250 стопа са деблом пречника 10 стопа.
Цветнице
Вегетација Хондураса је врло богата. Научници процењују да у Хондурасу постоји више од 5.000 врста биљака. Цветних биљака има у већини делова земље, где обезбеђују храну за инсекте и птице. Једна од најплоднијих биљних врста у Хондурасу је жалфија (Салвиа). Кадуља брескве (Салвиа дорисиана), кадуља Карвинског (С. карвинскии) и кадуља плаве винове лозе (Салвиа цацалиифолиа) све су грмолике, вишегодишње врсте које успевају у хладним, планинским шумама централног Хондураса. Некада извор хране за аутохтоне људе, жути лотос (Нелумбо лутеа) једна је од ретких цветних биљака пронађених у шумама мангрове. Познат по жутим цветовима у облику чаше, често се гаји у воденим вртовима као украсна биљка.