Пустиња је сурово, суво окружење, али биљке и животиње које су се прилагодиле тим условима успевају у овим екосистемима. Од орлова до мрава, постоји разнолика врста биљака и животиња које живе и комуницирају једни с другима у пустињама широм света. Као и сви екосистеми, мрежа интеракција врста може бити крхка, а изумирање врста може имати велики ефекат. Идентитет изгубљеног организма и његова улога у екосистему одређује како се утиче на ланац исхране.
Ланци пустињске хране
Сви екосистеми су састављени од врста које имају различите улоге у прехрамбеном ланцу. У пустињи су грмље и кактуси примарни произвођачи и чине основу ланца исхране. Даље, постоје мали биљоједи који једу биљке као што су:
- мишеви
- Преријски пси
- мрави
- скакавци
Изнад овог трофичног нивоа постоје мезопредатори попут лисица, змија и гуштера који плијене мале потрошаче. Коначно, на врху прехрамбеног ланца, животиње попут пума и орлова биће плијен свих врста испод себе. Улога врста која изумре игра велику улогу у утицају на прехрамбени ланац.
Функционални вишак
Нису сва изумирања имала велики утицај на екосистеме. Понекад постоји пуно различитих врста које у суштини обављају исти посао или функцију у екосистему. Ако једна од ових врста изумре, друге ће се повећати и обављати исти посао. Таква „заменљива“ врста назива се функционално сувишна. С обзиром да су пустиње сурово окружење, врсте су сличније једна другој јер им требају сличне адаптације да би преживеле. На пример, Гуофанг Лиу из Кинеске академије наука открио је да биљке у пустињској степи Монголије имају мање функционалне разноликости од биљака на ливади и типичног монголског. То може указивати на то да изумирање биљака у пустињи можда неће имати толико велики утицај као изумирање у другим екосистемима.
Кеистоне Врсте
Понекад изумирање може имати несразмерно велики утицај на екосистем. Тако важне врсте називају се кључним врстама. Често су кључне врсте предатори који одржавају стабилност целокупног екосистема. Најпознатији пример је врста морске звезде - Писастер оцхрацеус - на вашингтонској обали. Када се уклони са стјеновите проливе, изумру и многе друге врсте. Врхунски предатори у пустињи као што су пума и орлови су такође важни. Још једна кључна врста у америчкој пустињи су колибри. То су важни опрашивачи пустињских кактуса који подржавају низ других врста. Када се колибри изгубе, многе пустињске биљке нестају и врсте које о њима зависе.
Домино изумирање и други ефекти
Понекад су врсте уско повезане са другом врстом. Када један оде, онај други који је о њему зависио иде исто као и домине које се међусобно обарају. Одличан пример у пустињи је однос између преријских паса и црних ногу. Црноноги папари зависе од преријских паса за храну. Када су преријски пси отерани на мали број због тровања, у већини места црни папкац је изумро. Изумирање врста такође може променити структуру пустињске хране. На пример, ако велики кенгуру пацови изумру на пустињским травњацима, травњак се претвара у грмље јер је изгубљен важан посао грабежљивости семена који су кенгурушки пацови обављали.