Морски екосистем је под великим стресом; у многим областима су услови неопходни за одржавање живота или угрожени или не постоје. Уништавање морских станишта посебно је распрострањено дуж обала где се повећала људска популација. Губитак станишта, загађење, прекомерни риболов, деструктивне праксе риболова и глобално загревање сви подривају морско окружење.
Цоастлинес
Губитак станишта, загађење, отицање и повећана сланост уништавају коралне гребене, морске траве и друга станишта за птице и рибе. Како се обалне мочваре попуњавају како би се прилагодило растућој људској популацији, забијање река смањује проток слатке воде, успорава отицање хранљивих материја и спречава миграцију риба. Мање слатке воде значи повећану сланост у мочварама и ушћу, што штети травама које пречишћавају воду док тече у море. Ерозија изазвана крчењем шума шаље муљ у реке, потоке и на крају у океан, блокирајући сунчеву светлост потребну за преживљавање коралних гребена.
Прекомерни риболов
Риболовни биолози израчунавају максимални одрживи принос како би процијенили количину рибе која се може уловити од популације без ризика од њене дугорочне одрживости. Између 1974. и 1999. године, удео рибарства који је премашио максимални одрживи принос бакалара се утростручио, са 10 на 30 процената. Према Центру за океанска решења, укупан улов од почетка 1990-их у једном од највећих на свету продуктивни риболов, Охотско море, смањио се два и два и по пута због претерани риболов. У Тихом океану више од половине острвских држава не управља одрживо својим коралним гребенима.
Морско дно
Користећи праксу познату као дно коћање, комерцијална рибарска пловила вуку велике мреже причвршћене за велике утеге преко морског дна. Циљне врсте укључују шкампе, бакалар, морски лист и иверку, али све дуж морског дна је заробљено. Дно кочењем морски екосустав може трајно оштетити, а прилов (нециљане врсте попут морских корњача, морских птица и сисара) једноставно се баци преко палубе. Прилов може износити 90% укупног улова и често се убијају угрожене рибе и дубокоморски корали.
Закисељавање
Како се клима загрева, океан апсорбује више угљен-диоксида, чинећи га киселијим. Повећана киселост инхибира способност морских организама да развијају шкољке, а то укључује и ситне животиње зване планктон које чине основу прехрамбене мреже океана. Неки истраживачи сугеришу да ће ово такође узроковати да неке морске врсте емитују мање сумпорних једињења која промовишу стварање облака, што хлади Земљу. Климатски модели предвиђају да ће ово проузроковати 0,5 степени Целзијуса (0,28 степени Фахренхеита) додатног загревања током овог века.
