Центрифуга је уређај који се састоји од одељка који се врти на централној оси. Кретање предења доводи до раздвајања материјала на основу њихове различите гравитације. Ротор центрифуге је ротирајућа јединица центрифуге која има фиксне рупе избушене под углом. Епрувете се постављају унутар ових рупа и ротор се окреће да би помогао у одвајању материјала. Постоје три врсте ротора за центрифуге: ротор са окретном кашиком, ротор са фиксним углом и вертикални.
Ротор са окретном кашиком обично подржава узорке у запремини од 36 мл до 2,2 мл. Кашике за замах могу подржати две врсте раздвајања: зонско брзу и изопикничку. Кашике за замах су пожељније за раздвајање зона од брзине, јер је растојање између спољне стране менискуса и спољне стране дна цеви довољно дуго да дође до раздвајања.
Ротори са фиксним углом обично се користе за пелетирање било честица пелета из суспензије и уклањања вишка отпадака или сакупљања пелета. Шупљине ротора се крећу од 0,2 мл до 1 мл. Најважнији аспект при одлуци да се користи ротор са фиксним углом је фактор К. К фактор показује колико ефикасно ротор може пелетирати при максималној брзини. Што је нижи фактор К, већа је ефикасност пелетирања.
Вертикални ротори су високо специјализовани. Обично се користе за везивање ДНК у цезијум хлорид. Вертикални ротори имају врло ниске К факторе, што је корисно ако се честица мора померати само на кратком растојању док се не пелетира. Време рада на вертикалним роторима је кратко.