Merkur je soncu najbližji planet in je v povprečju oddaljen 57 milijonov kilometrov. To je manj kot 40 odstotkov razdalje od Zemlje do sonca. Orbita Merkurja je eliptična, njegova oddaljenost od sonca pa se spreminja za 24 milijonov kilometrov.
Za razliko od Zemlje, ki kroži sonce v skoraj krožni orbiti, Merkur kroži v elipsi. Ekscentričnost Merkurjeve orbite, ki je merilo, kako močno se razlikuje od krožne orbite, je 0,2056. To je več kot 10-krat večja od ekscentričnosti zemeljske orbite, ki je 0,0167. Pravzaprav je to najbolj ekscentrična orbita izmed vseh osmih planetov v sončnem sistemu.
Za razliko od kroga elipsa nima središča; namesto tega ima dva žarišča in v primeru Merkurjeve orbite sonce zasede enega izmed njih. Ko je Merkur najbližji soncu, je oddaljen le 46 milijonov kilometrov, ko pa je planet zaokroža nasprotni fokus svoje orbite, od njega je oddaljen 70 milijonov kilometrov sonce. Ker Merkurjevi polovi niso nagnjeni glede na njegovo orbito, so temperaturne razlike, ki jih povzroča njegova spreminjajoča se razdalja do sonca, najbližje sezonam, ki jih ima planet.