Ko vzorce DNK zaženete na agaroznem gelu in posnamete sliko, jo lahko shranite za pozneje, nato lahko rezultate analizirate in interpretirate. Vrste stvari, ki jih iščete, bodo odvisne od narave vašega eksperimenta. Če na primer opravljate prstne odtise DNK, boste želeli primerjati velikost kosov DNK iz dveh vzorcev - morda od osumljenca in od vzorca kraja zločina. Če delate s plazmidi iz bakterij, boste morda morali zagotoviti, da plazmid vsebuje vložek. Posledično bo način razlage gela deloma odvisen od eksperimenta, ki ste ga opravili. Kljub temu lahko uporabite nekaj splošnih pravil.
Upoštevajte, da boste morda uporabili navodila v tem razdelku ali pa tudi ne. Pogosto se z elektroforezo v agaroznem gelu potrdi, da plazmid vsebuje dani vložek. Če ne delate s plazmidi, lahko preskočite ta razdelek. Če pa ste, lahko sledite tem navodilom.
Upoštevajte, da če delate z neobrezanimi ali odrezanimi plazmidi, ne morete oceniti velikosti po postopku iz zgornjega oddelka 1. To je zato, ker se nerezani in odrezani plazmidi z linearno DNA selijo različno hitro.
Primerjajte število pasov na vsakem pasu. Spomnimo se, da restrikcijski encim reže DNA na mestih, kjer se pojavi določeno zaporedje, imenovano restrikcijsko mesto. Če bi vzorec obdelali z DVA restrikcijskima encimoma, morata biti prisotna trak za vložek in trak za preostanek plazmida. Razlog za to je, da bo vložek obdan z dvema restrikcijskima mestoma, vsako za različen encim, zato bodo kosi na obeh mestih vložek osvobodili plazmida. Nasprotno bo rez na enem mestu pretvoril plazmid v linearno DNA. Vzorec, razrezan brez restrikcijskih encimov ali enega restrikcijskega encima, mora imeti en pas, medtem ko mora biti vzorec, rezan z dvema restrikcijskima encimoma, z dvema pasovima.
Bodite pozorni na pasove, ki jih je ustvarila rezana plazmidna DNA. Zarezani plazmid ima rez samo v eni verigi, zato se seli počasneje kot odrezan plazmid. Izrezani plazmidi se nato selijo počasneje kot nerezana DNA.
Ocenite velikost vložka po postopku, opisanem v oddelku 1, in ugotovite, ali ustreza vašim pričakovanjem (ki se razlikujejo glede na poskus).
Stvari, ki jih boste potrebovali
- Svinčnik
- Papir
- Program preglednic
- Slika vašega gela
- Vladar