V življenjskih ciklih rastlinskih semen semena ostanejo v stanju mirovanja pred fazami kalitve. Med obdobji mirovanja se zgodi malo aktivnosti, saj semena čakajo na ustrezne okoljske pogoje za rast. Ko se kalivost začne, se stopnje celičnega dihanja močno povečajo, da se zagotovijo potrebni materiali za začetne faze rasti rastlin.
Procesi celičnega dihanja celicam omogočajo pretvorbo obstoječih hranilnih snovi v energijo. V obdobju mirovanja rastlinska semena počivajo ravno toliko, da ohranijo hrano ali zaloge hranil v specializiranem sloju semen, znanem kot endosperm. Znotraj cvetočih rastlin so endospermne strukture plod dvojnega gnojenja, ki poteka, ko je prvič oplojena jajčna rastlina ali jajčnik. Endosperm dejansko zagotavlja potrebe po hranilnih snovi semena in izvaja potrebne celične funkcije dihanja v celotnem obdobju mirovanja. Začetek kalitve postavlja na seme velike potrebe po energiji, ko se oblikujejo procesi rasti rastlin. Posledično se stopnje celičnega dihanja povečajo, da se prilagodijo dejavnostim gradnje celic, ki so potrebne, da seme odpre in ustvari začetne koreninske in stebelne strukture.
Semena rastlin izvirajo iz cvetja, sadja, zelenih rastlin in dreves, ki rastejo v nešteto okoljskih pogojih. Ni presenetljivo, da vsaka vrsta semena išče določene okoljske sprožilce, ki spodbujajo začetek kalitvenih procesov. Po navedbah univerze Cornell se lahko okoljski sprožilci pojavijo kot povečana raven hranil v tla, spremembe temperature tal, povečane količine padavin ali povečanje količine in kakovosti svetloba. Ko so izpolnjeni potrebni pogoji, začnejo semena povečevati stopnjo absorpcije vode, kar pomeni začetek kalitve. Povečanje absorpcije vode omogoča, da semena mobilizirajo zaloge hrane, shranjene v plasteh endosperma. Ti procesi aktivirajo nekatere encime, ki sprožijo povečanje stopnje celičnega dihanja semena.
Kalijoča semena izvajajo procese celičnega dihanja na enak način kot rastlinske in živalske celice. Celično dihanje poteka v treh fazah, začenši z glikolizo. V fazi glikolize molekule glukoze proizvajajo dve enoti energije ali molekule ATP (adenozin trifosfat) skupaj z drugimi kemičnimi materiali. Krebsov cikel predstavlja drugo stopnjo celičnega dihanja. V tej fazi izdelki iz glikolize proizvedejo še dve energijski enoti in kemikalije, ki ostanejo od glikolize, pretvorijo v molekule, ki prenašajo vodik. Elektronska transportna veriga je tretja stopnja v dihalnem procesu in jo poganjata dve molekuli ATP, ki nastaneta v Krebsovem ciklu. Ta stopnja združuje energijo, ki jo vsebujejo molekule vodika iz Krebsovega cikla, s kisikom in tako ustvari 38 molekul ATP. Ta tristopenjski postopek se znova in znova ponavlja v vsaki posamezni rastlinski celici. Molekule ATP, proizvedene s celičnim dihanjem, zagotavljajo energijo za začetek kalitve in spodbujajo dejavnosti gradnje celic, ki na koncu tvorijo rastlinsko telo.