DNA vsebuje kodirana navodila, ki jih potrebujejo vaše celice za delovanje. V evkarionu, organizmu z jedrom v vsaki celici, se DNK shrani znotraj jedra, zato navodila je treba poslati v celico, tako da jih najprej naredimo v polimeru, imenovanem messenger RNA oz mRNA. mRNA urejajo celični stroji, preden zapusti jedro, in ji dodajo več pomembnih molekularnih lastnosti, da jo označijo kot končano in pripravljeno za uporabo.
Zapiranje mRNA
Prva kemična modifikacija, ki jo imajo vse evkariontske mRNA, se imenuje 5 'kapica. Encim RNA polimeraza potuje vzdolž verige DNA, tako da ustvari kopijo ali prepis RNA. Konec polimera RNA, kjer je RNA polimeraza začela sintetizirati, se imenuje 5 'konec. Trije drugi encimi na 5 'koncu dodajo kemično skupino, imenovano 7-metilgvanilat; ta sprememba se imenuje cap. Če se mRNA pojavi v celici brez 5 'pokrovčka, jo lahko razgradijo drugi encimi; navodila, ki jih vsebuje, ne bodo nikoli prevedena. 5 'pokrovček označuje mRNA kot legitimno in jo ščiti pred razgradnjo.
Poliadenilacija
Druga univerzalna modifikacija, ki jo najdemo le v evkariontski mRNA, je poli-A rep. 5 'konec mRNA je tam, kjer se je RNA polimeraza začela, 3' rep pa tam, kjer se konča. Po transkripciji encim, imenovan poli (A) polimeraza, doda od 100 do 250 dodatnih adenozin ali A podenot, od tod tudi ime poli A rep. Zdi se, da ta rep naredi mRNA bolj stabilno in jo označi kot namenjeno za izvoz iz jedra.
Funkcije za spremembe
5 'kape in poli-A repi najdemo v vseh evkariontskih mRNA. Vendar pa bakterije in drugi prokarionti uporabljajo tudi mRNA, vendar njihove mRNA nimajo teh dveh lastnosti. Eukariontsko mRNA včasih urejajo ali spajajo, preden zapusti jedro, zato morajo regulirati, katere mRNA lahko zapustijo jedro. Poleg tega je prevajanje navodil, kodiranih v mRNA, veliko bolj urejen postopek pri evkariontih in te spremembe imajo v tem procesu tudi pomembno vlogo. Za razliko od evkariontov, prokarionti nimajo jedra, zato ni potrebe po uravnavanju vstopa ali izstopa mRNA - takoj ko se mRNA transkribira, se sprosti v celici.
Virusi in mRNA
Ko virus okuži evkariontsko celico, mora patogen zagotoviti, da gostiteljska celica preneha proizvajati lastne beljakovine in namesto tega začne proizvajati virusne beljakovine in RNA. Nekateri, kot so poliovirusi in pikornavirusi, vsebujejo encim, ki seseka beljakovine, potrebne za prevajanje navodil, shranjenih v 5'-zaprti mRNA. Kot rezultat se ne prevede nobena lastna mRNA celic, namesto tega pa se prevede virusna RNA, ki ni omejena. S tem prevzamejo tisto, kar bi lahko bila odgovornost - njihovo lastno pomanjkanje 5'-kapice - in to spremenijo v prednost.