Mikroaerofili so mikroorganizmi, ki jih prisotnost kisika sama po sebi ne uniči, vendar lahko v svojem okolju prenašajo le pod-atmosferske ravni kisika. To jih uvršča v presnovni spekter med obveznimi anaerobi, ki jih dejansko ubijejo kisika in obvezni aerobi, ki zahtevajo enako splošno raven kisika kot vi in večina drugih življenj obrazci. Kisik obsega približno 21 odstotkov zemeljskih atmosferskih plinov; mikroaerofili najbolje uspevajo v medijih z bistveno manj od tega, vendar potrebujejo vsaj nekaj, da uspejo.
Mikroaerofilne bakterije so primeri aerotolerantnih anaerobov. Kisik za mikroaerofile je precej podoben mineralu, kakršen je železo za ljudi: vsi ljudje potrebujejo majhne količine železa, da preživijo, vendar je presežek železa strupen. Zaradi teh bakterij encimi zahtevajo razgradnjo strupenih stranskih produktov aerobne presnove, vendar v manjših količinah v primerjavi z aerobnimi organizmi.
V svetu nalezljivih (patogenih) bolezni je veliko primerov aerotolerantnih bakterij. To je predvsem zato, ker lahko kisik doseže nekatere dele notranjosti telesa, vendar ne v količinah, ki so jim izpostavljene zunanjost in pljuča.
Vibrio
Bakterije v tem rodu so ravne ali ukrivljene in so pri barvanju z barvilom gramnegativne (bakterije so običajno razvrščene kot gram pozitivne ali gram negativne). Natrij spodbuja Vibrio rast in uspevajo v vodnih okoljih. V tej skupini V. kolere in V. parahaemolyticus so glavni vzroki za bolezni pri ljudeh. Vibrio bakterije lahko povzročijo drisko ali okužbe zunaj črevesnega trakta.
Campylobacter
Ti mikroaerofili so lahko v obliki črke S, ukrivljeni ali v obliki palice in so povezani z okužbami prebavil. Pogosto se prenašajo z živali (zlasti z živino) na ljudi, zboleti pa je mogoče, ko v telo vstopi le nekaj sto teh organizmov. Kontaminirana hrana in voda lahko tudi proizvedeta Campylobacter okužbe.
Legionela
Legionellae so majhne gram negativne bakterije, ki povzročajo blage do resne, celo usodne bolezni dihal. Znani so po tem, da uspevajo v ogrevani vodi, kot so masažne kadi. Legionellae najdemo jih v naravnih vodnih telesih, pa tudi v človeških, kot so rezervoarji za toplo vodo. Obstaja 20 različnih Legionela vrste, ki so bile od leta 2018 povezane s človeško boleznijo.
Neisseria
Neisseriae so gramnegativne bakterije, ki so najbolj znane po tem, da pri ljudeh povzročajo gonorejo, spolno prenosljivo bolezen. Od leta 2004 naj bi bilo okuženih 112 od 100.000 ljudi v ZDA ali približno eden od 900 ljudi. Bolezen je mogoče učinkovito zdraviti z antibiotiki. V redkih primerih lahko povzroči okužbo oči, imenovano konjunktivitis.
Helicobacter
Helicobacteriae so gramnegativne in so običajno ukrivljene ali spiralne oblike, kar jim daje ime. Odkriti leta 1982 naseljujejo človeška črevesja in so bili vpleteni v gastritis ali vnetje želodca, skupaj z nekaterimi vrstami čir na želodcu. V telesu lahko vztrajajo tudi dlje časa, ne da bi povzročili bolezen.
