HPLC (visoko zmogljiva tekočinska kromatografija) in GC (plinska kromatografija) sta oba znanstvenika metod uporabite za analizo vzorcev, da ugotovite, kaj vsebuje vzorec ali koncentracija molekul v vzorec. Oba uporabljata isto načelo, da se bodo težje molekule počasneje eluirale ali pretakale kot lažje (polarnost ima tudi vlogo v času elucije). Čeprav je ideja enaka, imata GC in HPLC več razlik.
Mobilna faza
Mobilna faza kromatografske opreme je snov, ki vzorec premika skozi stroj. V HPLC je mobilna faza tekočina, sestavljena iz organskega topila, ultračiste vode in drugih sestavin, da se zagotovi združljivost z vzorcem. GC za svojo mobilno fazo uporablja plin. Plini vključujejo helij, dušik, argon ali vodik, odvisno od tega, kaj se analizira.
Stolpci
Ko vzorci potujejo čez kromatografske kolone, vzorec in mobilna faza sodelujeta z vsebino kolone, zaradi česar se komponente vzorca eluirajo ob različnem času. Stolpi HPLC so običajno štiri do šest centimetrov dolge kovinske ali steklene cevi, tesno zapakirane s silicijevim dioksidom ali različnimi dolžinami ogljikove verige. GC sistemi imajo navite kapilarne stebre z notranjimi stenami, prevlečenimi z različnimi materiali, odvisno od potreb laboratorija. Iztegnjeni stebri GC lahko dosežejo dolžino 100 čevljev.
Vzorci
GC se uporablja za hlapne spojine (tiste, ki se hitro razgradijo), medtem ko je HPLC boljši za manj hlapne vzorce. Če vzorec vsebuje soli ali vsebuje naboj, ga je treba analizirati s HPLC in ne z GC.
Nadzor temperature
GC stebri so nameščeni v pečici znotraj stroja. Med analizo vzorcev računalnik spreminja temperaturo. Višja kot je temperatura, hitreje se vzorec eluira, vendar previsoke temperature dajejo slabe rezultate. HPLC-kolone imajo ves čas stabilno temperaturo (najpogosteje sobno).