Ekosistem sestavljajo vsi živi organizmi na določenem območju in njihove interakcije z okoljem okoli njih. Ekosistemi temeljijo bodisi na kopnem bodisi na vodi. Pennsylvania, geografsko raznolika država, se nahaja v srednjem Atlantiku severovzhodnem delu ZDA in vsebuje štiri skupne ekosisteme: gozdove, jezera, reke in mokrišče.
Gozdovi
Ko gre za ekosisteme Pensilvanije, prevladujejo gozdovi. Po podatkih Penn Statea več kot 16 milijonov hektarjev gozda pokriva 58 odstotkov državne površine. Gozdovi so zapleteni ekosistemi, ki podpirajo raznolikost rastlinskega in živalskega sveta. Pensilvanski gozdovi zagotavljajo habitate za večino divjih živali v državi. Gozdni ekosistemi Pensilvanije sestavljajo različna drevesa, kot so javor, češnja in hrast. Gozdovi ponujajo ekonomsko pomembne izdelke, kot so les, ginseng in javorjev sirup. Ščitijo tudi porečja države, ki vsebujejo večino sladke vode države. Penn State prepoznava različne grožnje gozdnim ekosistemom, vključno s kislim dežjem in širjenjem urbanizacije. Prizadevanja za ohranjanje so usmerjena v izobraževanje državljanov Pensilvanije o pomenu upravljanja virov, kot je sajenje dreves.
Mokrišče
Mokrišča, nasičena z vodo, gostijo rastline, primerne za mokra okolja. V Pensilvaniji se mokrišča pojavljajo na poplavnih ravnicah ob rekah in potokih, ob robovih jezer in v gozdnih močvirjih ali barjih. So pomembna gojišča in drstišča rib, dvoživk in vodnih kokoši. Ti ekosistemi zagotavljajo tudi življenjski prostor nekaterim ogroženim ali ogroženim vrstam Pensilvanije, na primer ameriški grenki. Zvezne vladne agencije, vključno z ameriško službo za ribe in prosto živeče živali in državne agencije, kot je Ministrstvo za varstvo okolja v Pensilvaniji, zaščitite državne mokriške ekosisteme legalizacija.
Jezera
Po podatkih oddelka za ohranjanje in naravne vire v Pensilvaniji Pensilvanija vsebuje približno 2500 vodnih teles. Večina jezer so pravzaprav veliki ribniki ali umetni rezervoarji. Sladkovodni ekosistemi vsebujejo raznolikost življenja, kot so ribe, nevretenčarji, dvoživke in rastline. Zagotavljajo tudi vire pitne vode za divje živali in ljudi. Ministrstvo za varstvo in naravne vire v Pensilvaniji identificira invazivne vrste podvodnih rastlin kot nevarnosti za avtohtone rastline v jezerih. Ljudje so prispevali tudi k zmanjševanju populacije avtohtonih rastlin s pršenjem herbicidov v vodo, da bi uničili invazivne vrste. Prizadevanja za ohranjanje so usmerjena v izobraževanje lastnikov domov v Pensilvaniji o škodi, ki jo herbicidi povzročajo avtohtonim rastlinam.
Reke
Skozi Pensilvanijo teče veliko rek, vključno z rekami Ohio, Susquehanna in Allegheny. Po vsej državi tvorijo množico sladkovodnih ekosistemov. Po podatkih Zaščitnega območja Zahodne Pensilvanije so reke najbolj ogroženi ekosistemi v Severni Ameriki. Človeške dejavnosti so povzročile izgubo biotske raznovrstnosti v rečnih habitatih Pensilvanije. Zajezitev je upočasnila pretok vode v številnih rekah, kar škoduje kakovosti vode. Poleg tega je premogovništvo onesnažilo številne vodne poti. Po porečju reke Ohio država ostaja eden najrazličnejših sladkovodnih ekosistemov, naseljen z bogatimi vrstami rib in mehkužcev, v skladu z Zahodno zaščito Pensilvanije. Prizadevanja za ohranjanje še naprej ohranjajo to bogato raznolikost.