Ako určiť alelové frekvencie

Deoxyribonukleová kyselina, ľudovejšie známa ako DNA, je molekula nachádzajúca sa vo veľkej väčšine živých organizmov a vírusov nachádzajúcich sa na Zemi. DNA nesie genetická informácia, alebo kód, ktorý robí všetko tým, čím je.

DNA sa líši medzi druhmi a medzi jednotlivcami v rámci druhu. Napríklad u ľudí určuje DNA farbu ľudských očí, pokožky, vlasov, výšky a všetkých ďalších atribútov, vďaka ktorým je každý človek jedinečný.

DNA sa skladá z rôznych génov. Gény nesú genetickú informáciu od každého rodiča.

Každý gén sa nachádza na špecifickom mieste v chromozóme. Môže mať nejaký gén viac variácií pripravené z rôznych alelových sekvencií.

Alely určiť viditeľné individuálne vlastnosti, tzv fenotypy. Napríklad modrá, zelená, hnedá a lieska sú rôzne fenotypy pre ľudské oko.

Pri pohľade na jeden z mnohých génov na farbu očí v skupine ľudí by osoby s modrými očami mali inú sekvenciu alel ako tie s hnedými, orieškovými a zelenými očami.

Frekvencia alel je počet jedincov v populácii, ktorí majú a

Tieto informácie poskytujú pochopenie genetickej rozmanitosti v populácii. Keď sa v priebehu času zaznamenajú alelové frekvencie, možno pozorovať zmeny v genetickej diverzite.

Na výpočet frekvencie alel je potrebné spočítať celkový počet jedincov v populácii. Potom spočítajte počet jedincov, ktoré majú každý konkrétny konkrétny fenotyp.

Vytvorte záznam o všetkých súčtoch. Ak chcete zistiť alelové frekvencie, vydelte počet, koľko sa alela v populácii spočíta, celkovým počtom kópií alely nájdených v danom géne.

Povedzme napríklad, že v populácii je 100 jedincov a dva typy alel: B pre modré oči a G pre zelené oči. Každá osoba má dve kópie každej alely, takže vynásobte dve 100 a získajte v populácii 200 alelových kópií.

V skutočnom živote existuje veľa génov, ktoré kódujú farbu očí človeka, ale pre tento scenár existujú v tomto genofonde iba tri rôzne kombinácie alel; BB, BG a GG. Ďalej spočítajte počet ľudí v populácii s každým typom alely.

V tomto príklade je 50 ľudí s BB, 23 ľudí s BG a 27 ľudí s GG. Ak chcete nájsť genotypové frekvencie, jednoducho vydelte počet ľudí so špecifickým fenotypom celkovým počtom ľudí.

V tomto prípade 50 BB delené 100 ľuďmi znamená, že 50 percent populácie má genotyp BB. Génová frekvencia pre BG by bola 23 percent a 27 percent ľudí v genofonde by malo typ génu GG.

Zatiaľ čo genotypové frekvencie sledujú expresiu génov, frekvencie alel sledujú počet výskytov konkrétnej alely v populácii. Ak chcete zistiť alelovú frekvenciu B v tomto príklade, vynásobte 50 dvoma, pretože v genotype BB sú dve B.

Potom pridajte ľudí s genotypom BG, pretože tiež každý z nich má alelu B, čo dáva celkom 123 alel B. Nakoniec rozdeľte 123 na 200 ako každá osoba v populácii má dve alely, čo dáva frekvenciu alel 0,615 alebo 61,5 percenta.

Ďalej urobte to isté pre alelu G. Vynásobením 27 ľudí s alelami GG dvomi a pridaním 23 ľudí, ktorí majú tiež alelu G, potom vydelením tohto počtu, 77, 200, dosiahneme 0,385 alebo 38,5 percenta.

Skontrolujte chyby a zaistite, aby všetky frekvencie alely dosiahli 1 alebo 100 percent. Tu sa 61,5 pridaných k 38,5 rovná 100.

Tieto výpočty poskytli informácie o tom, koľko ľudí má modré fenotypové oči a koľko má zelené fenotypové oči u tejto populácie 100 ľudí. Z frekvencií alel je zrejmé, že alela B je v populácii dominantnejšia.

Pokračovaním v tejto štúdii v ďalších generáciách bude zrejmé, či dôjde k zmenám vo frekvenciách alel v priebehu času, a poskytneme určitý pohľad na vývoj populácie.