Začnite proces identifikácie neznámych baktérií sledovaním ich fyzikálnych vlastností, ako sú bunková stena, tvar a väzby. Na ďalšie zúženie vašej identifikácie použite štandardné laboratórne postupy, ako je farbenie buniek, kultivácia a sekvenovanie DNA. Baktérie sú zvyčajne zoskupené do druhov podľa ich fyzikálnych a metabolických vlastností, a nie podľa vzájomných genetických vzťahov.
Pozitívne alebo negatívne
Eubaktérie sú takzvané skutočné baktérie. Líšia sa od archaeí alebo archebaktérií, ktoré tvoria samostatné kráľovstvo. Eubaktérie sú prokaryoty, čo znamená, že im chýba jadrová membrána. Väčšina z nich má bunkové membrány a bunkové steny. Baktérie so silnými bunkovými stenami sa označujú ako grampozitívne, pretože sú náchylné na smrť počas testu nazývaného Gramovo farbenie. Gramovo zafarbenie je prvý test používaný v bakteriálnej klasifikácii. Baktérie s tenkými alebo neprítomnými bunkovými stenami sú gramnegatívne, pretože nezachytávajú farbivo podľa Grama.
Formovanie baktérií
Sférické baktérie sa nazývajú koky, baktérie, ktoré tvoria priame tyčinky, sa nazývajú bacily a baktérie so stredným tvarom sa nazývajú kokobacily. Všetky môžu byť gramnegatívne alebo grampozitívne. Tuhé baktérie v tvare špirály sú známe ako spirilla a sú iba gramnegatívne. Pružné, nezávisle pohyblivé špirálovité baktérie sa nazývajú spirochety a sú gramneutrálne. Nakoniec sa tuhé tyčinky v tvare čiarky nazývajú vibrácie a sú gramnegatívne. Niekoľko málo známych a zle pochopených baktérií má rôzne tvary, napríklad hviezdnu hviezdu a labry v tvare sekery. Existujú tiež dve prechodné bakteriálne skupiny. Rickettsia sú podobné vírusom, majú rôzne tvary, sú gramnegatívne a môžu prežiť iba vo vnútri iných buniek. Mykoplazme, podobné hubám, chýbajú bunkové steny a zahŕňajú mnoho druhovo špecifických pľúcnych patogénov spôsobujúcich zápal pľúc.
Kocky, zhluky a ďalšie prepojenia
Koky a bacily sa ďalej klasifikujú podľa väzieb, ktoré tvoria po rozdelení buniek. Diplookoky a diplobacily sa lepia do párov. Streptokoky a streptobacily tvoria reťazce. Tetrad koky zostávajú na štvorcoch štyroch baktérií. Sarcinae cocci tvoria osembaktérové kocky a stafylokoky tvoria zhluky.
Identifikácia baktérie
Ak máte neznáme baktérie a chcete ich identifikovať, zvyčajne vykonáte gramové zafarbenie a potom pozorujete vzhľad kolónie a jednotlivé znaky. V tom okamihu môžete povedať, že máte napríklad gramnegatívne aeróbne streptobacily. Potom môžete svoju vzorku porovnať s rôznymi známymi baktériami tak, že ju umiestnite na rôzne kultivačné médiá podporovať rast niektorých druhov a brzdiť iné, alebo testovaním vzorky na rôzne známe bakteriálne látky vedľajšie produkty. Ako posledná možnosť môže sekvenovanie DNA určiť, či máte známy alebo neznámy bakteriálny druh alebo kmeň, za predpokladu, že ho porovnávate s druhom alebo kmeňom, ktorého genóm už bol sekvenovaný.