Bunky obsahujú DNA, ktorá slúži ako vzor bielkovín, ktoré môže každá bunka zužitkovať v celom organizme. Účelom ribozómov - ich biologickej funkcie - je prečítať kópie tohto plánu a zostaviť dlhé molekulárne reťazce, z ktorých sa stanú proteíny. Ribozómy fungujú v živočíšnej alebo rastlinnej bunke využitím RNA, molekuly úzko súvisiace s DNA. Na splnenie ich dôležitej úlohy sa ribozómy nachádzajú v celej bunke a ich umiestnenie odráža cieľ proteínov, ktoré produkujú.
Nucleolus
V eukaryotickej bunke, bunke s jadrom, sa ribozómy začínajú v špecializovanej časti jadra, ktorá sa nazýva jadro. Nukleolus je zhluk DNA obsahujúci gény, ktoré nesú kód pre jednu ribozomálnu zložku, molekulu nazývanú ribozomálna RNA, ktorá úzko súvisí s DNA. Ribozomálna RNA sa syntetizuje a viaže sa na proteíny v jadre, potom sa z jadra exportuje za vzniku ribozómov. Prokaryotické bunky, ktorým chýbajú jadrá, uskutočňujú tento proces v cytoplazme.
Cytoplazma
Aj keď prokaryotické bunky a eukaryotické bunky tvoria svoje ribozómy na rôznych miestach bunky, oba majú ribozómy voľne plávajúce ako súčasť cytoplazmy, materiálu obsiahnutého v bunke membrána. Voľné ribozómy eukaryotických buniek sú všeobecne väčšie ako ribozómy prokaryotických buniek a obsahujú väčšiu škálu ribozomálnych RNA a proteínov. Voľné ribozómy v oboch bunkách sú však dôležité pri zostavovaní proteínov potrebných pre vlastné procesy bunky.
Endoplazmatické retikulum
Eukaryotické bunky majú cytoplazmatické štruktúry, ktoré prokaryotickým bunkám chýbajú. Jednou z takýchto štruktúr je endoplazmatické retikulum alebo ER, rad membránou uzavretých kanálov, kde bunka vytvára zlúčeniny na použitie mimo svojej vlastnej cytoplazmy. Mnoho ribozómov sa pripája k ER a vytvára proteíny, ktoré sa stávajú fixovanými ribozómami. Bielkoviny vyrobené v ribozómovo bodkovanej časti ER, nazývané „drsný ER“, sa dopravujú cez hladký ER bez ribozómov, aby sa stali zložkami bunkovej membrány alebo produktmi na konzumáciu inými bunkami.
Mitochondrie a chloroplasty
Niektoré obzvlášť zložité štruktúry vo vnútri eukaryotických buniek obsahujú svoj vlastný genetický materiál. Mitochondrie, ktoré generujú energiu rozkladom sacharidov, a chloroplasty, ktoré ukladajú energiu ako cukor pre rastliny, riasy a niektoré huby majú svoju vlastnú DNA spolu s ribozómami, aby ju mohli čítať inštrukcie. Tieto ribozómy sú malé, ako prokaryotické ribozómy, ale stále pomáhajú mitochondriám a chloroplastom vytvárať proteíny, čo podporuje myšlienku, že tieto štruktúry sa vyvinuli z baktérií, ktoré vo väčšej miere žili bunky.