Fylogenetický strom je grafické znázornenie evolučných vzťahov, ktoré demonštruje, ako sa mohli organizmy odlišovať od spoločného predka. Predtým sa to robilo porovnaním anatómie a fyziológie živých organizmov a fosílií, ale teraz sa bežne používa genetická informácia získaná z nukleotidových sekvencií DNA. Na samostatných „konároch“ fylogenetického stromu možno nájsť organizmy s malou podobnosťou a tie, ktoré majú špecifické spoločné znaky, by sa nachádzali na „vetvách“ tej istej vetvy. Fylogenetický strom je metóda na pochopenie druhov a evolučných zmien v organizmoch.
Vyberte modelový organizmus na porovnanie vzťahov. To je možné vykonať pomocou druhu, plemena alebo nukleotidovej sekvencie, ktorá predstavuje organizmus. Príkladom organizmu môže byť krava. Zvyšok stromu by na základe genetických znakov demonštroval, ako veľmi je krava príbuzná s inými organizmami.
Vyberte si outgroup. Skupinou je menej príbuzný organizmus alebo úplne iná nukleotidová sekvencia. Ak je modelovým organizmom krava, možnou outgroup by bola ryba. Čím sú dva rôzne organizmy rozdielnejšie, tým ďalej sa na fylogenetickom strome stane ich rozchádzajúcim sa vetviacim bodom. Čas je vyjadrený tak, že najstarší dátum je v spodnej časti tabuľky a súčasný deň je v hornej časti tabuľky. Umiestnenie konárov ukazuje približne to, keď v minulosti evolučná vlastnosť pravdepodobne zmenila organizmus predkov na rôzne druhy.
Určte množinu charakteristík, ktoré sa majú použiť na porovnanie. Príklady zahŕňajú „má štyri nohy“, „prežúva“, „živo rodí“ alebo „rastie vlasy“. Nukleotidové sekvencie sú spravodlivé abecedné znázornenia DNA, ktoré určujú charakteristiky, takže iná možnosť by bola: „obsahuje sekvenciu ATGGACACGGA. "
Rozdeľte organizmy na základe charakteristík. Keď jeden organizmus neobsahuje požadovanú vlastnosť, vytvorí sa vetva vo fylogenetickom strome. Charakteristické „má štyri nohy“, kravy, ovce a jelene by boli na jednej vetve, zatiaľ čo ryby by boli na samostatnej vetve. Vložte obrázok alebo postupnosť kravy do horného rohu plagátu a ryby do opačného rohu a nakreslite z nich dve čiary na spodok papiera v tvare pretínajúceho sa písmena V.
Pokračujte v separácii modelových organizmov alebo nukleotidových sekvencií, kým každý príklad nemá samostatnú separáciu z vetvy na vetvičku. Charakteristika „má vlnu“ by oddelovala ovce od jeleňov a kráv na jednotnú vetvu. Umiestnite obraz ovce blízko obrázka ryby a nakreslite čiaru, ktorá sa spája v tvare V, až po vetvu kravy. Použitím charakteristiky „má nadýchaný chvost“ by sa vymedzila krava od jeleňa. Vložte obrázok jeleňa medzi kravu a ovce a nakreslite ďalšiu čiaru do tvaru V, ktorá sa pretína nad rybou a ovcou. Keď má každý druh jednu vetvu, bol fylogenetický strom dokončený.