Pojem genotyp označuje kompletnú genetickú výbavu organizmu. Používa sa tiež pri opise rôznych variácií génu známeho ako alely. Ľudia majú dve alely pre každú genetickú pozíciu alebo lokus. Dohromady sa každá dvojica alel považuje za špecifický genotyp.
Poznanie genotypu alebo príkladu genotypu jednotlivca môže byť dôležité pre pochopenie genetického prejavu, diagnostiku chorôb, poznávanie genetických mutácií a ďalšie.
Definícia genotypu
Začnime konkrétnou definíciou genotypu. Genotyp jednotlivca je dedičná genetická informácia, ktorú daný jedinec má. Toto odkazuje na vaše gény, DNA, alely atď. V jednom komplexnom slove. Príkladom môže byť opis farebného genotypu kvetu ako RR (čo znamená, že majú dve „červené“ alely RR pre svoju farbu) alebo Rr (jedna „červená“ alela R a jedna „ružová“ alela r pre farbu). .
Váš fenotyp je na druhej strane to, čo a jednotlivec fyzicky ukazuje, že je to dané genotypom, ktorý má. Aj keď dvaja jedinci môžu mať rovnaký fenotyp, môžu mať úplne odlišné genotypy. Podľa príkladu kvetov z minulosti sa kvety RR aj Rr javia ako červené, pretože červená je dominantná nad ružovou. Líšia sa však svojim genotypom, pretože jeden je homozygotný (RR) a druhý je heterozygotný (Rr).
Prečítajte si viac o definícii, alelách a príkladoch genotypov.
Poznanie genotypu: Punnettovo námestie
Punnettov štvorec je jedným z najjednoduchších spôsobov určenia genotypu. Štvorec je vlastne mini-graf, ktorý sa používa na určenie potenciálneho genotypu potomka s ohľadom na konkrétnu vlastnosť.
Ak chcete vytvoriť Punnettov štvorec, napíšte všetky možné alely do hornej časti štvorca pre jedného rodiča a všetky možné alely pre druhého rodiča nadol na ľavú stranu. Každá uvedená alela sa vo vnútri štvorca stane buď stĺpcom, pre najvyššie alely, alebo riadkom, pre alely na ľavej strane. Štvorec sa vyplní, keď budete do dolných stĺpcov zapisovať alely zhora zapíšte si alely zo strany do svojich príslušných riadkov a vytvorte štvorec plný potenciálu genotypy.
Príkladom genotypu využívajúcim Punnettov štvorec sú klasické experimenty s hráškom, ktoré uskutočnil Gregor Mendel. Pozrite si príklady konkrétnych genotypov a Punnettove štvorce tu.
Polymerická reťazová reakcia
Polymerázová reťazová reakcia (PCR), vyvinutá v 80. rokoch, generuje špecifický porast DNA založený na templátovom vlákne. Okrem templátového vlákna je pre PCR reakciu nevyhnutná DNA polymeráza, nukleotidy a krátke kúsky jednovláknovej DNA.
V určitom okamihu začne reakcia PCR generovať kópie exponenciálne a iba počas tejto fázy je možné určiť pôvodné množstvo cieľovej sekvencie vo vzorke. Táto metóda sa používa na účely sekvenovania, klonovania a genetického inžinierstva.
Prečítajte si viac o rozdieloch medzi klonovaním PCR.
Hybridizačná sonda
Hybridizačná sonda sa používa na určenie, či je fyzikálna charakteristika spôsobená genotypom. Proces začína úplným natrávením DNA, ktorá sa má analyzovať, po ktorej nasleduje jej prenos na filtračnú membránu. Potom sa sonda pridá k filtru a nechá sa naviazať na cieľovú sekvenciu.
Po asi 24 hodinách sa filter premyje, aby sa odstránila všetka neviazaná sonda. Hybridizačný prob sa dá použiť aj na stanovenie účinnosti procesu klonovania alebo na zistenie počtu kópií konkrétneho génu.
Priame sekvenovanie DNA
Projekt Human Genome Project viedol k vývoju množstva výkonných nástrojov na sekvenovanie DNA. Okrem dekódovania kompletného genómu z Homo sapiens, tieto nástroje umožnili vedcom sekvenovať kompletné genómy mnohých ďalších organizmov, vrátane myší, potkanov a ryže. Najmodernejšie sekvenčné nástroje umožňujú dnešným genetikom rýchlo a lacno porovnávať a manipulovať s veľkým množstvom DNA.
To umožní určiť úlohu genetiky v náchylnosti na choroby, genetickej odpovedi organizmov na environmentálne stimuly a sledovanie vývoja znaku alebo druhu, uvádza National Human Genome Research Inštitút.