Dve prokaryotické ríše sú Eubacteria a Archaea. Prokaryot je pomerne jednoduchý jednobunkový organizmus; zložitejšie organizmy (vrátane všetkých mnohobunkových organizmov) sú eukaryoty. Predtým tu bolo iba jedno kráľovstvo prokaryotov, známe ako Monera. Keď však vedci objavili nové a bizarnejšie formy života, bolo treba vytvoriť nové kráľovstvo.
Charakteristika prokaryota
V porovnaní s eukaryotmi sú prokaryoty relatívne jednoduché jednobunkové organizmy. Prokaryoty majú iba zlomok množstva DNA ako eukaryoty a chýbajú im zložitejšie organely, ako sú mitochondrie. Dôležité je, že DNA prokaryota nie je obsiahnutá v jadre (čo je hlavný rozdiel medzi prokaryotmi a eukaryotmi), ale naopak voľne pláva v bunke. Prokaryoty sa môžu zapojiť do sexuálnej alebo nepohlavnej reprodukcie a niektoré majú chloroplastové organely, ktoré im umožňujú pripraviť si jedlo pomocou procesu fotosyntézy.
Eubaktérie
Eubacteria Kingdom je prokaryotické kráľovstvo, ktoré je známe už viac ako sto rokov, predovšetkým preto, že sú to baktérie, ktoré spôsobujú choroby u ľudí (tiež známe ako a patogén). Existujú tisíce známych druhov eubaktérií, aj keď sú zvyčajne rozdelené podľa tvarov: tyčové, špirálové a sférické. Eubaktérie sú dôležité pre globálny ekosystém, pretože rozkladajú mŕtvy organický materiál na dusík, ktorý sa potom vracia do atmosféry a používa sa na hnojenie rastlín.
Archaea
Kráľovstvo Archaea je relatívne nové prokaryotické kráľovstvo a jeho organizmy sa od eubaktérií líšia prostredím, v ktorom žijú. Archaea sa líši od takmer všetkých ostatných foriem života, pretože môže prežiť v extrémnom prostredí, napríklad na dne morských otvorov alebo v kyslej vode. Rovnako ako eubaktérie, existuje veľké množstvo druhov Archaea, pričom niektoré z nich sa nenachádzajú v žiadnom iné organizmy, napríklad Halobacterium, ktoré používajú slanú vodu na napájanie protónovej pumpy, ktorá jej dodáva energiu.
Vírusy
Napriek podobnosti s eubaktériami a Archeami sa vírusy nepovažujú za prokaryotické organizmy, a preto nemajú svoje vlastné kráľovstvo. Aj keď majú genetické informácie zakódované v DNA ako prokaryoty, vírusy neobsahujú žiadne iné organely ani sa nesprávajú ako prokaryoty. Vírusy sa musia množiť, aby sa zachytili na bunkách iných organizmov; tento nedostatok nezávislých prostriedkov na rozmnožovanie je dôležitým dôvodom, prečo vírusy nie sú klasifikované ako organizmus.
