Proces výroby proteínu zo sekvencie DNA - deoxyribonukleovej kyseliny - zahrnuje dva hlavné kroky: transkripciu a transláciu. Počas transkripcie sa z templátu DNA vytvorí messengerová ribonukleová kyselina alebo mRNA. Táto mRNA sa kombinuje s ribozomálnou RNA, známou ako rRNA, a komplexom prenosovej RNA alebo tRNA na transláciu mRNA kódu na aminokyselinovú sekvenciu, proteín. DNA je tvorená sekvenciou nukleotidových báz. Štyri bázami sú adenín, tymín, guanín a cytozín. Sekvencia, v ktorej sa tieto bázy vyskytujú na vlákne DNA, nakoniec kóduje produkciu určitých proteínov. Keď si bunka vyrobí proteíny, môžu sa použiť štruktúrne alebo pri rôznych metabolických procesoch.
Vytvorte mRNA prepis sekvencie DNA. Každá báza v DNA sa zhoduje s inou bázou. Fotografie DNA ju typicky ukazujú v dvojzávitnici, pričom bázy na jednom vlákne sa spájajú väzbami s komplementárnymi bázami na opačnom vlákne. Doplnkovými bázami sú: adenín (A) a tymín (T) a cytozín (C) a guanín (G). Takže ak jeden reťazec DNA číta A-C-G-C-T-A, potom komplementárne vlákno je T-G-C-G-A-T. Sekvenciu mRNA transkriptu môžete nájsť rovnakým spôsobom pomocou komplementov báz znázornených v sekvencii DNA. RNA však neobsahuje bázický tymín (T); namiesto toho je táto báza nahradená uracilom (U). Ak narazíte na adenín (A) v sekvencii DNA, porovnajte ho s uracilom (U).
Ak je sekvenciou DNA A-A-T-C-G-C-T-T-A-C-G-A, potom mRNA sekvencia je U-U-A-G-C-G-A-A-U-G-C-U.
Vytvorte tRNA antikodónovú sekvenciu z mRNA transkriptu. Každá tRNA má na sebe súbor troch báz známych ako antikodón. Antikodón sa zhoduje s komplementárnymi bázami v sekvencii mRNA. Aby ste určili celkovú antikodónovú sekvenciu, ktorá bude zodpovedať vláknu mRNA, jednoducho prepíšte sekvenciu RNA; inými slovami, vypíšte doplnkové základy. Použitím skôr uvedenej sekvencie mRNA je tRNA anti-kodónová sekvencia A-A-T-C-G-C-U-U-A-C-G-A.
Nájdenú sekvenciu tRNA rozlomte na tri bázy. Pretože antikodóny sú tvorené súčasne tromi bázami, lepším spôsobom zápisu protikodónovej sekvencie A-A-T-C-G-C-U-U-A-C-G-A je AAT-CGC-UUA-CGA.
Tipy
-
Antikodónovú sekvenciu nájdete ešte rýchlejšie jednoduchým napísaním sekvencie DNA pomocou U pre uracil namiesto T pre tymín. Potom rozdelte sekvenciu na tri základné antikodóny.
Antikodónovú sekvenciu môžete použiť na zosúladenie s proteínmi pridanými každou tRNA počas translácie, čím sa vytvorí aminokyselinová sekvencia. Overte si však, že referenčná tabuľka aminokyselín, ktorú používate, je pre antikodóny (pozri Zdroje). Mnoho grafov sekvenovania aminokyselín jednoducho uvádza zoznam zodpovedajúcich mRNA kodónov namiesto tRNA antikodónov, čo vám umožňuje preskočiť krok stanovenia antikodónovej sekvencie.
Sekvencia molekuly tRNA je jednoducho transkripciou RNA sekvencie DNA použitej na jej vytvorenie.