Púšť Mojave je domovom niekoľkých rýchlo sa rozvíjajúcich púštnych komunít a je prístupná veľkej populácii hraničiacej s púšťou. Znečistenie spôsobené mestskými, poľnohospodárskymi a ťažobnými činnosťami vážne ovplyvňuje krehké púštne ekosystémy Mojave a tiež ohrozuje ľudské zdravie. Okrem toho veľké množstvo ľudí používa Mojave na rekreáciu, čo spôsobuje ďalšiu degradáciu.
Znečistenie vody
•••Jupiterimages / Photos.com / Getty Images
Voda je v Mojave vzácnym zdrojom. Takmer všetka voda na obytné, priemyselné a poľnohospodárske účely sa získava z podzemných vôd. Zdroje vody sú už nadmerne pridelené. Na základe prognóz rastu populácie sa predpokladá, že dopyt v priebehu nášho života prevýši ponuku. Odber vody odvádza mokrade a rieky a ničí biotop mnohých druhov rýb a voľne žijúcich živočíchov, z ktorých niektoré sú jedinečné pre Mojave. Časť vody sa vracia do vodonosných vrstiev a povrchových vôd, ale pretože táto voda odteká z mestskej, poľnohospodárskej a ťažobnej pôdy, je často kontaminovaná chemikáliami, kovmi a živinami.
Invázne rastliny
•••Stockbyte / Stockbyte / Getty Images
Obohatenie pôdy dusíkom spôsobené suchým pádom znečisťujúcich látok zo vzduchu spolu s narušením pôdy zmenili Mojave na útočisko pre invázne rastliny. Premiestnenie pôvodných druhov rastlín inváznymi druhmi má veľa nepriaznivých vplyvov na ekosystém Mojave. Invázne rastliny nemusia byť vhodné pre pôvodnú divočinu, ktorá často závisí od pôvodnej vegetácie, pokiaľ ide o jedlo alebo úkryt. So zvyšujúcou sa rozmanitosťou introdukovaných rastlín navyše prichádza do úvahy potenciál invázie introdukovaných zvierat. Niektoré bežné invázne druhy rastlín sú soľ, brome trávy, vytrvalé korenie a ruský bodliak. Tieto druhy rastú na oveľa väčších plochách ako pôvodné rastliny a poskytujú tak ďalšie palivo pre čoraz častejšie a intenzívnejšie požiare. To predstavuje veľký problém pre ekosystémy Mojave, ktoré nie sú zvyknuté na časté spaľovanie.
Znečistenie vzduchu
•••Photos.com/Photos.com/Getty Images
V Mojave sú dva hlavné zdroje znečisťovania ovzdušia. Prvým je smog, ktorý sa do púšte dopravuje z hraničiacich miest. Smog obsahuje vysoké koncentrácie oxidu uhoľnatého a oxidu dusičitého, ako aj ozónu, pevných častíc a kovov. Tieto znečisťujúce látky v ovzduší spôsobujú zlú viditeľnosť, zdravotné ťažkosti ľudí a poškodenie rastlín a zvierat. Druhým zdrojom je narušenie púštnej pôdy spôsobené činnosťami, ako sú rekreácia v teréne, poľnohospodárstvo, výstavba infraštruktúry, vojenské výcvikové výcviky a ťažba. Tieto činnosti vytvárajú prach, ktorý sa môže agregovať do veľkých oblakov. To sa ukázalo ako obzvlášť škodlivé pre púštnu vegetáciu. V článku publikovanom v časopise „Journal of Applied Ecology“ z augusta 1997 vedci zistili, že vetrom rozfukovaný prach znižoval rýchlosti fotosyntézy troch pôvodných druhov rastlín Mojave zabránením výmeny plynov a transpirácie a zníženou účinnosťou použitie vody.
Znečistenie vrhov
•••Jupiterimages / Photos.com / Getty Images
Púšť Mojave je kritickým prostredím pre púštnu korytnačku, ktorá je v súčasnosti označená ako chránená americkou službou pre ryby a divočinu. Úpadok púštnej korytnačky možno úplne pripísať zmenám biotopov vyvolaných ľuďmi. Článok publikovaný v januári 2007 v časopise „Prírodovedec pre západnú Severnú Ameriku“ informuje o účinkoch odpadu na púštne korytnačky v púšti Mojave. Autori poznamenávajú, že smrť alebo poranenie korytnačiek ulovených v podstielke alebo zvierat, ktoré podstielku konzumujú, nie sú ničím novým. Po tom, čo boli svedkami toho, ako korytnačka jedla balón, si všimli, že do ich študijného miesta Mojave za deväť mesiacov nafúkalo 178 nových balónov. Vyradené odpadky sú negatívne ovplyvnené aj na mnoho ďalších druhov divej zveri.