V Malajzii, ktorá je známa svojou biodiverzitou, žije 15 000 kvitnúcich rastlín. Flóra a fauna národa sú však vážne ohrozené a zaznamenali 70-percentné zníženie pôvodného rastu. Podľa Červeného zoznamu Medzinárodnej únie na ochranu prírody (IUCN) má Malajzia od roku 2007 686 ohrozených druhov rastlín. Malajzijské zákony chránia vtáky, cicavce a hmyz. Flóra a fauna sú chránené, iba ak rastú v národnom parku alebo v rezervácii.
Medzi hlavné lesné typy v Malajzii patria Giam Kanching alebo vzácny dipterokarpový les, mangrovové lesy, rašeliniská a močaristé lesy, uvádza Worldwide Wildlife Fund. Strom dipterokarp, známy svojim plodom s dvojkrídlovými semenami, rastie na pevnine, ktorá je tesne nad hladinou mora, do nadmorskej výšky približne 900 metrov. Nížinné dipterokarpové lesy, ktoré sa nachádzajú až do výšky 300 metrov nad morom, boli zdecimované z dôvodu poľnohospodárstva a iných pôdne náročných činností. Zatiaľ čo v lesnej rezervácii Kanching je chránená kapsa dipterokarpov, tento druh je na Červenom zozname považovaný za kriticky ohrozený - na pokraji vyhynutia.
Táto mäsožravá tropická rastlina rastie iba v machových lesoch v nadmorskej výške 2 000 až 2 600 metrov na hore Trus Madi na Borneu. Nepenthes macrophylla má džbánkovité listy, ktoré sa visia z desať metrov dlhej liany. Podľa ASEAN Review of Biodiversity & Conservation of Conservation (ASEAN) sa hmyz voskuje z voskovitého vrchu kvetu do kaluže kyseliny vylučovanej žľazami v dolnej časti kvetu. Červený zoznam IUCN kategorizuje Nepenthes macrophylla ako kriticky ohrozené.
Taxitheliella richardsii, ktorá je na Červenom zozname kriticky ohrozená, je mach v rodine Sematophyllaceae a pochádza z Malajzie. Jedinou známou oblasťou (necelých 10 km²), kde sa mach našiel, je Sarawak, malajzijský štát na severozápade Bornea. Taxitheliella richardsii rastie na drevnatých viničoch a zhnitej guľatine v subtropických lesoch, čo je biotop, ktorý mizne v dôsledku ťažby a ťažby dreva.
