Honduras je druhý najväčší národ v Strednej Amerike a tiahne sa šírom od Karibiku po Tichý oceán. Napriek agresívnemu odlesňovaniu si Honduras stále udržiava zalesnenejšiu oblasť ako väčšina ostatných krajín v regióne. Krajine dominuje niekoľko druhov lesov, medzi ktoré patrí oblačný les, borovicový les, dažďový les a mangrovy. Rastlinné a živočíšne druhy sú bohaté na rozmanité lesné ekosystémy Hondurasu, vrátane druhov, ktoré zmizli zo zvyšku regiónu. Na ochranu rozmanitosti života v tejto oblasti bolo vyčlenených viac ako jedno honduraské útočisko pre divokú zver.
Cicavce v Hondurase
V lesoch Hondurasu sa nachádza viac ako 200 druhov cicavcov. Medzi honduraské zvieratá patrí niekoľko vzácnych tvorov. Netopiere (Chiroptera) tvoria takmer polovicu cicavcov v krajine, kde 98 známych druhov zaberá každý lesný ekosystém. Ikonický jaguár (Panthera onca) je jedným z najvzácnejších druhov v celej Strednej Amerike. Najčastejšie sa v mangrovových oblastiach vyskytujú jaguáre, ktoré sú v Hondurase ohrozeným druhom. Západoindické kapustňáky (Trichechus manatus), kedysi bežné pozdĺž karibského pobrežia Hondurasu, sú dnes zriedka viditeľné okrem odľahlých mangrovových oblastí. Honduraské národné zviera, jelenček bielochvostý (Odocoileus virginianus), je najväčším jeleňovým druhom v krajine. Jeleň obyčajný je najčastejšie pozorovaný v nížinách a borovicových lesoch a je chráneným druhom. V Hondurase sa tiež nachádza veľké množstvo opíc vrátane kapucínky bielohlavej (Cebus capucinus), Mexický, spider monkey, (Ateles, geoffroyi, vellerosus), a, golden-mantled, opice, opice, (Alouatta, palliata palliata).
Hojnosť vtákov
Honduras má mimoriadne bohatú rozmanitosť druhov vtákov. Existuje 18 druhov papagájov, medzi ktoré patrí andulka oranžová (Brotogeris jugularis), papagáj zelený (Ara) ambigua), tichomorský andulka (Aratinga strenua) a macaw šarlátový (Ara macao), ktorý je honduraským národným vtákom. Lastovička čierna (Notiochelidon pileata), ktorá sa nachádza vo vysokohorských tropických lesoch, je sťahovavý vták bežný v Hondurase. Tukan gaštanový (Ramphastos swainsonii) je častým javom v pobrežných nížinných lesoch Hondurasu. Známe pre svoju pestrofarebnú tvár a prehnaný účet, niekedy sú chované ako domáce zvieratá napriek tomu, že sú chráneným druhom.
Tropické stromy
Každý lesný ekosystém má základný druh, čo znamená, že jeden druh definuje typ lesa. V Hondurase hranice čierneho mangrovového stromu (Avicennia germinans) a červeného mangrovového stromu (Rhizopora mangle) naznačujú hranice mangrovového ekosystému. Stromy mahagónu (Swietenia macrophylla) sú niekedy zmiešané s mangrovovými druhmi na suchu, čo naznačuje začiatok pobrežných nížinných borovicových lesov. Borovica honduraská (Pinus caribaea var. hondurensis) a borovica ocote (Pinus oocarpa) sú jediné dva druhy borovíc v krajine, aj keď dominujú na obrovských plochách nížinného lesa. Jedným z najpôsobivejších stromov v Hondurase je ceiba (Ceiba pentandra). Niekedy sa tomu hovorí kapok, je to mohutný strom, ktorý môže s kmeňom s dĺžkou 10 stôp dosiahnuť 250 stôp na výšku.
Kvitnúce rastliny
Honduraská vegetácia je veľmi bohatá. Vedci odhadujú, že v Hondurase sa nachádza viac ako 5 000 druhov rastlín. Kvitnúce rastliny sú bohaté na väčšinu oblastí krajiny, kde poskytujú potravu pre druhy hmyzu a vtákov. Jedným z najplodnejších druhov rastlín v Hondurase je šalvia (Salvia). Šalvia broskyňová (Salvia dorisiana), Karwinského šalvia (S. karwinskii) a šalvia modrá (Salvia cacaliifolia) sú všetky krovinné, trváce druhy, ktoré kvitnú v chladných horských lesoch v strednom Hondurase. Kedysi zdroj potravy pre pôvodných obyvateľov je žltý lotos (Nelumbo lutea) jednou z mála kvitnúcich rastlín, ktoré sa vyskytujú v mangrovových lesoch. Známy pre svoje žlté kvety v tvare pohára, často sa pestuje vo vodných záhradách ako okrasná rastlina.