Zafíry, ako každý prírodne sa vyskytujúci drahokam, sú tvorené rôznymi posunmi, miešaniami a chemickými zmenami, ktoré na Zemi neustále prebiehajú. Zafíry sa vytvárajú určitými posunmi tepla a tlaku a možno ich nájsť v metamorfovaných aj vyvretých horninách. Medzi skaly, v ktorých sa dajú zafíry dostať, patrí žula, bridlica, rula, nefalínový syenit a rôzne ďalšie. Môžu sa tiež vyskytovať v nánosoch naplavenín. Keď sa zafíry tvoria prírodným spôsobom, sú šesťuholníkové a nazýva sa ich korund. Vďaka pozoruhodnej tvrdosti zafírov, ktoré sú na druhom mieste za diamantom, sú vysoko cenené.
Korund možno nájsť v rôznych farbách; považuje sa však za zafír, iba ak nie je červený. Červený korund sa označuje ako rubín. Počas tvorby korundu závisí zafarbenie kameňa od toho, aké minerály sú v ňom prítomné. Napríklad, ak je prítomné železo, môžu mať zafíry zelený alebo žltý odtieň, zatiaľ čo prítomnosť vanádu vytvorí fialové zafíry. Najcennejšie zafíry sú modré, ktoré sú výsledkom prítomnosti titánu pri formovaní kameňa.
S pokrokom v oblasti vedy a techniky boli vyvinuté metódy pre umelé pestovanie zafírových kryštálov. Pôvodný proces bol objavený v roku 1902 a spočíval v pridaní práškového oxidu hlinitého do kyslíko-vodíkového plameňa, ktorý bol smerovaný nadol. Oxid hlinitý v tomto plameni sa pomaly „ukladá“ do tvaru slzy, ktorý sa nazýva boule. Do tohto procesu je možné pridávať rôzne chemikálie, ktoré vytvárajú zafíry s rôznymi odtieňmi a tiež červené rubíny. Zatiaľ čo od začiatku 20. storočia boli objavené ďalšie procesy, otvorili sa práve tieto umelé zafíry zintenzívniť používanie kameňa na technologické účely vrátane použitia v sklenených tabuliach a ako zaostrovacie zariadenia v lasery.