Len o niečo menšia veľkosť ako americký štát Colorado, ekosystémy Nového Zélandu čelia mnohým environmentálne výzvy, pretože krajina je ekonomicky rozvinutým národom aj ostrovom komunita. Zatiaľ čo mnohé rozvinuté krajiny ako USA čelia podobným ekosystémovým hrozbám, ako sú invazívne druhy a priemyselné znečistenie, ostrovné krajiny ako Nový Zéland čelia zvýšeným hrozbám zvyšovania globálnej hladiny mora a tlaku na prírodné zdroje, ako je oceán rybolovu.
Invázne druhy
Ľudské zavedenie nepôvodných živočíchov a rastlín do novozélandských ekosystémov malo vážny dopad na zdravie pôvodných druhov. Kiwi, nelietavý vták, ktorý je národným zvieraťom v krajine, čelí 90% hrozbe vyhynutia podľa novozélandského ministerstva ochrany všetky nové kurčatá zabíjajú invázne druhy, ako sú lasice. Invázne rastliny, ako je šplhavá špargľa, ovplyvňujú aj lesné ekosystémy Nového Zélandu tým, že sa rozširujú cez podzemok a bránia pôvodným rastlinám v regenerácii.
Priemyselné znečistenie
Odhaduje sa, že polovica všetkých jazier na Novom Zélande je znečistená, väčšina riek nespĺňa zdravotné normy podľa lesa a vtákov je polovica všetkých pôvodných rýb uvedená ako ohrozený druh Organizácia. Zdravie týchto vodných ciest a ich ekosystémov sa zhoršuje odvodňovaním prírodných mokradí, ktoré fungujú ako filtre pre sladkovodné útvary. Organizácia Forest and Bird odhaduje, že 90 percent mokradí Nového Zélandu bolo vypustených na výstavbu a rozvoj.
Zmena podnebia
Ako ostrovný štát sú ekosystémy Nového Zélandu ohrozené aj zvyšovaním morských hladín vyvolaným globálnou zmenou podnebia vyvolanou človekom. Novozélandské ministerstvo životného prostredia predpokladá, že predpokladané zvýšenie hladiny mora povedie k dosiahnutiu tohto cieľa zvýšená pobrežná erózia a väčšie prenikanie morskej vody do brakických ústia riek hrozby. Takéto zmeny ohrozujú ekosystémy dún a brehov spoločenstiev, ktoré sa môžu stratiť eróziou, a ekosystémy ústia riek, ktoré nie sú schopné tolerovať slanosť čistej morskej vody.
Znižovanie biodiverzity
Rozmanitosť a zdravie rastlín a živočíchov pomáha definovať silný ekosystém a bežne sa označuje ako biodiverzita. Lov a ničenie biotopov na Novom Zélande viedli k tomu, čo ministerstvo životného prostredia považuje za „vážny pokles“. Úradníci odhadujú, že 32 percent pôvodnej pôdy a sladkovodných vtákov na Novom Zélande vyhynulo a ďalších 800 druhov zvierat, rastlín a húb sa považuje za hrozil.
