Un copac filogenetic este o reprezentare grafică a relațiilor evolutive care demonstrează modul în care organismele ar fi putut diferi de un strămoș comun. Anterior, acest lucru se făcea prin compararea anatomiei și fiziologiei organismelor vii și a fosilelor, dar acum sunt utilizate în mod obișnuit informațiile genetice preluate din secvențele de nucleotide ADN. Organismele cu puține asemănări pot fi găsite pe „ramurile” separate ale unui copac filogenetic, iar cele cu puncte comune comune ar fi situate pe „ramurile” aceleiași ramuri. Un copac filogenetic este o metodă de înțelegere a speciilor și a schimbărilor evolutive ale organismelor.
Selectați un organism model pentru compararea relației. Acest lucru se poate face cu o specie, rasă sau secvență de nucleotide care reprezintă un organism. Un exemplu de organism ar putea fi o vacă. Restul arborelui ar demonstra cât de strâns legată este o vacă de alte organisme pe baza trăsăturilor genetice.
Alegeți un grup outgroup. Un grup exterior este un organism mai puțin înrudit sau o secvență de nucleotide foarte diferită. Dacă organismul model este o vacă, atunci un posibil grup ar fi un pește. Cu cât cele două organisme sunt mai diferite, cu atât arborele filogenetic va fi mai departe punctul de ramură divergent. Ora este reprezentată cu cea mai veche dată în partea de jos a graficului și ziua actuală fiind în partea de sus a graficului. Amplasarea ramurilor arată aproximativ când în trecut o trăsătură evolutivă a schimbat un organism ancestral în diferite specii.
Determinați un set de caracteristici de utilizat pentru comparație. Exemplele includ „are patru picioare”, „mestecă„, „dă naștere vie” sau „crește părul”. Secvențele nucleotidice sunt doar reprezentări alfabetice ale ADN-ului care determină caracteristici, deci o altă opțiune ar fi: „conține secvența ATGGACACGGA. "
Împărțiți organismele pe baza caracteristicilor. Când un organism nu conține trăsătura dorită, se formează o ramură în arborele filogenetic. Pentru caracteristicul „are patru picioare”, vacile, oile și căprioarele ar fi toate pe o ramură, în timp ce peștii ar fi pe o ramură separată. Lipiți imaginea sau secvența unei vaci în colțul superior al afișului și peștele în colțul opus și trageți două linii de la acestea la baza hârtiei într-o formă de V care se intersectează.
Continuați să separați organismele model sau secvențele de nucleotide până când fiecare exemplu are o singură separare de ramură într-o crenguță. Caracteristica „are lână” ar separa oile de cerbi și vaci pe o ramură singulară. Așezați imaginea oilor lângă imaginea peștilor și trageți o linie care se conectează în formă de V până la ramura vacii. Folosirea caracteristicii „are coadă pufoasă” ar delimita vaca de căprioare. Lipiți imaginea căprioarelor între vacă și oaie și trageți o altă linie într-o formă de V care se intersectează deasupra liniilor de pește și oaie. Când fiecare specie are o singură ramură, arborele filogenetic a fost finalizat.