A nefrídia, órgãos semelhantes a dutos tubulares enrolados, filtram e removem resíduos do corpo de uma minhoca. Em vermes menos desenvolvidos, como o verme achatado ou o rotífero, os nefrídios não são tão especializados e estão localizados em várias células por todo o corpo da criatura. Em vermes segmentados mais avançados, como a minhoca, os nefrídios normalmente são agrupados em pares em todos os segmentos do corpo do verme. Esses pares de nefrídios são nomeados por sua localização na anatomia dos vermes. Cada grupo compartilha semelhanças, são todos canais de resíduos, mas cada um também tem funções distintas.
A nefrídia faríngea consiste em um grande número de nefrídios menores agrupados em três conjuntos de presas emparelhadas. Esses nefrídios agrupados filtram o nitrogênio dos aglomerados de capilares circundantes. As extremidades de todas as nefridias faríngeas se encontram e formam um grande duto de descarte que é despejado na faringe e na câmara bucal, um tubo que se estende da boca até a faringe.
Os nefrídios septais estão localizados em ambos os lados dos septos - estruturas semelhantes a fios que prendem a pele aos órgãos abaixo deles - em fileiras de quarenta ou cinquenta nefrídios individuais. Eles aparecem após o 15º segmento e desembocam em um par de dutos excretores que conduzem à cavidade intestinal principal. Este sistema de nefrídia é responsável por manter o equilíbrio da água ou osmorregulação na minhoca.
Centenas (200 a 250 por segmento) de nefrídios tegumentares estão localizados ao longo da parede corporal da minhoca (em todos, exceto nos dois primeiros segmentos). Esses minúsculos nefrídios servem para canalizar os resíduos nitrogenados de dentro do verme para o solo externo.
