Gdy DNA przechodzi transkrypcję RNA, niewielka część dwuniciowego DNA rozpina się, umożliwiając enzymom transkrypcyjnym dostęp do nukleotydów. RNA tworzy się tylko na jednej z nici DNA i zawsze zaczyna się od kodonu lub trzynukleotydowego „słowa” TAC. W trakcie tworzenia RNA odpina się od DNA i unosi się swobodnie. Wygląda na to, że model RNA/DNA ma w środku bańkę z częściowo przyłączoną nicią RNA.
Podziel kulki piankowe na trzy stosy: 60 dla szkieletu cukrowego, 30 dla sekcji transkrypcji RNA i 40 dla standardowych nici DNA.
Wyznacz kolor dla każdego nukleotydu i głównego cukru. Na przykład adenozyna (A) jest pomarańczowa, tymina (T) jest żółta, guanina (G) jest zielona, cytozyna (C) jest niebieska, uracyl (U) jest różowa, a cukier jest fioletowy.
Pomaluj kulki ze stosu transkrypcji RNA według następującego wzoru: 6 jako T, 9 jako A, 3 jako U, 6 jako C i 6 jako G.
Pomaluj standardowe kulki nukleotydowe DNA, aby reprezentowały po 10 sztuk każdego z A, T, G i C.
Powtarzaj kroki od 1 do 3, aż uzyskasz osiem oddzielnych pasm, cztery z 10 kulkami cukru i cztery z pięcioma kulkami.
Połóż dwa z pięciu łańcuchów cukru na powierzchni roboczej tak, aby cukry na jednym końcu pasma stykały się, tworząc kąt 45 stopni.
Utwórz łańcuch RNA z pozostałymi kulkami z kroku 3 według następującego wzoru: (na górze) AUGCCGAUAU (na dole). Połącz łańcuch, umieszczając białą wykałaczkę pod kątem 90 stopni do wykałaczki włożonej w kroku 4.
Połącz dwa łańcuchy, naciskając zewnętrzne wykałaczki z pary baz utworzonej w kroku 5 procedury Sekcja „Klocki konstrukcyjne” na sąsiednie cukry w łańcuchu, kontynuując aż do dołączenia 10 baz pary.
Ułóż jedną z dwuniciowych, 10-cukrowych nici DNA poniżej części RNA, a drugą powyżej części RNA.