Rozpocznij proces identyfikacji nieznanych bakterii, obserwując ich cechy fizyczne, takie jak ściana komórkowa, kształt i połączenia. Użyj standardowych procedur laboratoryjnych, takich jak barwienie komórek, hodowanie i sekwencjonowanie DNA, aby jeszcze bardziej zawęzić identyfikację. Bakterie są generalnie pogrupowane w gatunki według ich cech fizycznych i metabolicznych, a nie ich genetycznych powiązań między sobą.
Pozytywny lub negatywny
Eubacteria to tak zwane prawdziwe bakterie. Różnią się od archeonów lub archebakterii, które tworzą oddzielne królestwo. Eubacteria są prokariotami, co oznacza, że nie mają błony jądrowej. Większość ma błony komórkowe i ściany komórkowe. Bakterie o grubych ściankach komórek są określane jako gram-dodatnie, ponieważ są podatne na śmierć podczas testu zwanego barwieniem Grama. Barwienie Grama jest pierwszym testem stosowanym w klasyfikacji bakterii. Bakterie o cienkich lub nieobecnych ściankach komórek są Gram-ujemne, ponieważ nie zatrzymują barwnika Grama.
Kształtowanie bakterii
Bakterie kuliste nazywane są cocci, bakterie tworzące proste pręciki nazywane są pałeczkami, a bakterie o pośrednim kształcie nazywane są coccobacilli. Wszystkie mogą być gram-ujemne lub gram-dodatnie. Sztywne bakterie o spiralnym kształcie są znane jako spirilla i są tylko gram-ujemne. Elastyczne, niezależnie mobilne bakterie o spiralnym kształcie nazywane są krętkami i są gram-obojętne. Wreszcie sztywne pręciki w kształcie przecinka nazywane są wibriomi i są gram-ujemne. Kilka mało znanych i słabo poznanych bakterii ma różne kształty, takie jak stella w kształcie gwiazdy i labrys w kształcie siekiery. Istnieją również dwie pośrednie grupy bakterii. Rickettsia są podobne do wirusów, mają różne kształty, są Gram-ujemne i mogą przetrwać tylko wewnątrz innych komórek. Mykoplazmy, które są podobne do grzybów, nie mają ścian komórkowych i zawierają wiele specyficznych gatunkowo patogenów płuc wywołujących zapalenie płuc.
Kostki, klastry i inne powiązania
Cocci i pałeczki są dalej klasyfikowane przez wiązania, które tworzą po podziale komórki. Diplokoki i diplobacilli sklejają się parami. Paciorkowce i paciorkowce tworzą łańcuchy. Tetrad cocci pozostają w kwadracie czterech bakterii. Sarcinae cocci tworzą ośmiobakteryjne kostki, a gronkowce tworzą grona.
Identyfikacja bakterii
Jeśli masz nieznaną bakterię i chcesz ją zidentyfikować, zazwyczaj wykonujesz barwienie metodą grama, a następnie obserwujesz wygląd kolonii i poszczególne cechy. W tym momencie możesz powiedzieć, że masz na przykład bakterie Gram-ujemne, tlenowe paciorkowce. Następnie możesz porównać swoją próbkę z różnymi znanymi bakteriami, umieszczając ją na różnych podłożach hodowlanych, które: stymulować wzrost niektórych gatunków i hamować inne lub testując próbkę pod kątem różnych znanych bakterii przez produkty. W ostateczności sekwencjonowanie DNA może określić, czy masz znany lub nieznany gatunek lub szczep bakterii, pod warunkiem, że porównujesz go z gatunkiem lub szczepem, którego genom został już zsekwencjonowany.