Honduras jest drugim co do wielkości krajem Ameryki Środkowej, rozciągającym się przez przesmyk od Karaibów po Pacyfik. Pomimo agresywnego wylesiania Honduras nadal utrzymuje więcej obszarów leśnych niż większość innych krajów w regionie. W krajobrazie dominuje kilka rodzajów lasów, w tym las mglisty, las sosnowy, las deszczowy i namorzyny. Gatunki roślin i zwierząt obfitują w różnorodne ekosystemy leśne Hondurasu, w tym gatunki, które zniknęły z reszty regionu. Więcej niż jedno ostoi dzikiej przyrody w Hondurasie zostało odłożonych w celu ochrony różnorodności życia na tym obszarze.
Ssaki w Hondurasie
W lasach Hondurasu występuje ponad 200 gatunków ssaków. Wśród zwierząt Hondurasu znajduje się kilka rzadkich stworzeń. Nietoperze (Chiroptera) stanowią prawie połowę ssaków w kraju, a 98 znanych gatunków zajmuje każdy ekosystem leśny. Kultowy jaguar (Panthera onca) jest jednym z najrzadszych gatunków w całej Ameryce Środkowej. Najczęściej spotykane na obszarach namorzynowych, jaguary są zagrożonym gatunkiem w Hondurasie. Manaty zachodnioindyjskie (Trichechus manatus), niegdyś powszechne wzdłuż karaibskiego wybrzeża Hondurasu, są obecnie rzadko spotykane, z wyjątkiem odległych obszarów namorzynowych. Narodowe zwierzę Hondurasu, jeleń wirginijski (Odocoileus virginianus), jest największym gatunkiem jelenia w kraju. Najczęściej spotykany na nizinach iw lasach sosnowych jeleń wirginijski jest gatunkiem chronionym. W Hondurasie znajduje się również wiele różnych małp, w tym kapucynka białogłowa (Cebus capucinus), Czepiak meksykański (Ateles geoffroyi vellerosus) i małpa wyjcowa (Alouatta palliata) palliata).
Obfitość ptaków
Honduras ma wyjątkowo bogatą różnorodność gatunków ptaków. Istnieje 18 gatunków papug, w tym papuga pomarańczowobroda (Brotogeris jugularis), ara zielona (Ara ambigua), papuga długoogonowa (Aratinga strenua) i ara szkarłatna (Ara macao), która jest narodowym ptakiem Hondurasu. Występująca w lasach tropikalnych na dużych wysokościach jaskółka czarnogłowa (Notiochelidon pileata) jest ptakiem wędrownym powszechnym w Hondurasie. Tukan kasztanowaty (Ramphastos swainsonii) jest częstym widokiem w przybrzeżnych lasach nizinnych Hondurasu. Znane z jaskrawej twarzy i przesadnego dzioba, czasami są trzymane jako zwierzęta domowe, mimo że są gatunkiem chronionym.
Drzewa Tropikalne
Każdy ekosystem leśny ma gatunek kluczowy, co oznacza, że jeden gatunek określa typ lasu. W Hondurasie czarne namorzyny (Avicennia germinans) i czerwone namorzyny (Rhizopora magle) wyznaczają granice ekosystemu namorzynowego. Drzewa mahoniowe (Swietenia macrophylla) są czasami przeplatane gatunkami namorzynowymi na suchym lądzie, co wskazuje na początek przybrzeżnych nizinnych lasów sosnowych. Sosna honduraska (Pinus caribaea var. hondurensis) i sosna ocote (Pinus oocarpa) to jedyne dwa gatunki sosny w kraju, choć dominują na ogromnych połaciach lasów nizinnych. Jednym z najbardziej imponujących drzew w Hondurasie jest ceiba (Ceiba pentandra). Czasami nazywane kapokiem, jest to masywne drzewo, które może osiągnąć 250 stóp wysokości z pniem o średnicy 10 stóp.
Rośliny kwitnące
Roślinność Hondurasu jest bardzo bogata. Naukowcy szacują, że w Hondurasie występuje ponad 5000 gatunków roślin. Rośliny kwitnące obfitują w większość obszarów kraju, gdzie stanowią pokarm dla gatunków owadów i ptaków. Jednym z najbardziej płodnych gatunków roślin w Hondurasie jest szałwia (szałwia). Szałwia brzoskwiniowa (Salvia dorisiana), szałwia Karwińskiego (S. karwinskii) i szałwia szałwiowa (Salvia cacaliifolia) to krzewiaste, wieloletnie gatunki, które kwitną w chłodnych, górskich lasach środkowego Hondurasu. Niegdyś źródło pożywienia dla rdzennych mieszkańców, żółty lotos (Nelumbo lutea) jest jedną z niewielu roślin kwitnących występujących w lasach namorzynowych. Znana z żółtych kwiatów w kształcie miseczki, często jest uprawiana w ogrodach wodnych jako roślina ozdobna.