Istnieje wiele różnych typów ekosystemów. Ekosystemy wodne stanowią dużą część światowych ekosystemów i można je sklasyfikować jako ekosystemy słodkowodne lub ekosystemy morskie. Mieszkańcy dowolnego typu ekosystemu będą przystosowani do przetrwania w określonym zestawie warunków, jakie przedstawia ten ekosystem.
Ekosystem to społeczność utrzymywana razem przez złożone interakcje między czynnikami biotycznymi i abiotycznymi na danym obszarze. Czynnikami biotycznymi ekosystemu są żywe części, takie jak rośliny, zwierzęta, bakterie i grzyby. Czynniki abiotyczne obejmują glebę, wodę i inne nieożywione elementy obecne w środowisku. Ekosystem może być tak duży jak pustynia lub tak mały jak basen pływowy. Będzie tylko tyle żywych istot, ile można utrzymać dzięki dostawom żywności. Interakcje, takie jak relacje drapieżnik-ofiara i sieć pokarmowa, determinują populację ekosystemu. Każda żywa istota ma do spełnienia rolę, która przyczynia się do ogólnego sukcesu i przetrwania ekosystemu.
Termin morski odnosi się do ekosystemu związanego z oceanami. Według Agencji Ochrony Środowiska EPA ekosystemy morskie stanowią około 70 procent światowych ekosystemów. Ekosystemy morskie są wyjątkowe ze względu na zawieszone w wodzie rozpuszczone związki, w szczególności sól. Organizmy tak małe jak mikroskopijny plankton i tak duże jak wieloryby zamieszkują różne typy ekosystemów morskich. Ekosystemy morskie obejmują oceany, ujścia rzek i słone bagna, rafy koralowe, lasy namorzynowe, laguny, łąki trawy morskiej wodorostów i strefę pływów rozciągającą się na plaże.
Istnieje wiele rodzajów ekosystemów słodkowodnych. Rzeki, jeziora, stawy i strumienie to najczęstsze źródła słodkiej wody. Za ekosystemy słodkowodne uważa się również zbiorniki wodne, tereny podmokłe i źródła wód gruntowych. Ekosystemy słodkowodne nie zawierają takich samych rozpuszczonych substancji w wodzie jak ekosystemy morskie, więc żyjące tam zwierzęta i rośliny nie przetrwałyby w ekosystemie morskim. Ponieważ słodka woda nie zawiera soli, jest bardziej podatna na zamarzanie i rozmrażanie. Rośliny i zwierzęta słodkowodne przystosowały się do przetrwania tego procesu. Mają również struktury oddechowe przystosowane specjalnie do wody słodkiej i wyewoluowały zachowania reprodukcyjne i żywieniowe, które umożliwiają im pomyślne przetrwanie w swoim środowisku.