På jorden driver solens energi vinden; så på Neptun, hvor solen ikke ser mye større ut enn en stjerne, ville du forvente svak vind. Det motsatte er imidlertid sant. Neptun har de sterkeste overflatevindene i solsystemet. Det meste av energien som driver disse vindene, kommer fra selve planeten.
Sammenlignet med noen av gassgigantplanetene, er jordens atmosfære et basseng av ro. På Jupiter når vindene i den lille røde flekken 618 kilometer i timen (384 miles i timen), som er nesten dobbelt så rask som vindene i den hardeste terrestriske orkanen. På Saturn kan vind i den øvre atmosfæren blåse nesten tre ganger hardere enn det, med 1800 kilometer i timen (1118 miles i timen). Selv disse vindene tar baksetet til de i nærheten av Neptuns store mørke flekk, som astronomer har klokket til 1.931 kilometer i timen (1200 miles i timen).
I likhet med Jupiter og Saturn genererer Neptun mer energi enn den mottar fra solen, og denne energien som stråler ut fra planetens kjerne er det som driver de sterke overflatevindene. Jupiter utstråler energi som er igjen fra dannelsen, og energien som Saturn utstråler er i stor grad et resultat av friksjon produsert av heliumregn. På Neptun fanger et teppe av metan - som er en klimagass - varme. Hvis planeten var som Uranus (som mangler en intern energikilde), ville den varmen strålt ut i rommet for lenge siden. I stedet for, selv om temperaturene er friske, utstråler planeten 2,7 ganger mer varme enn den mottar fra solen, noe som er nok til å drive sine voldsomme vinder.